More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0391 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  282  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1924  UspA domain-containing protein  52.11 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.164923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  35.66 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  34.97 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  38.19 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  35.81 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  35.62 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  36.67 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  32.62 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  32.62 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4478  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.25 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  34.03 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  36.81 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.27 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  34.04 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  36.11 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  36.81 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  32.41 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  34.04 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0597  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 170 aa  62  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  33.1 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  35.17 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46410  universal stress protein family  37.24 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4775  UspA domain protein  33.11 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  33.78 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  31.72 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  34.25 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  31.25 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.58 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.87 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  33.56 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  31.47 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 294 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.29 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  34.93 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.1 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  31.94 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.29 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  32.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  32.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  29.86 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2722  UspA domain protein  30.77 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.189807 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  32.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  32.9 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  32.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  32.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  31.47 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  31.51 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  32.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  31.58 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.01 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  28.29 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  32.45 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.72 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  29.53 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.43 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  32.14 
 
 		 294 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  33.33 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3866  hypothetical protein  31.72 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  35.66 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  26.53 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  34 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  31.51 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.11 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  28.47 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  30.56 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0206  UspA domain protein  32.19 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00002541  normal  0.702914 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  29.8 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  34.21 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 		 274 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  47.27 
 
 		 180 aa  53.5  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  28.17 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>