More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0384 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0384  trypsin-like serine protease  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368801  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
403 aa  83.2  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0421  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.57 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.01 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.9 
 
 
388 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3400  trypsin-like serine protease  30.77 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.72 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  28.73 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  24.27 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.17 
 
 
485 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  30.54 
 
 
502 aa  63.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  28.89 
 
 
513 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  29.78 
 
 
524 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  30.57 
 
 
480 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  28.98 
 
 
386 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  28.42 
 
 
395 aa  62.4  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  29.75 
 
 
398 aa  62.4  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.67 
 
 
364 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  28.41 
 
 
402 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  28.41 
 
 
386 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  32.65 
 
 
467 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1904  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.43 
 
 
416 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0620222  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  30.51 
 
 
471 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28 
 
 
412 aa  59.7  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  27.84 
 
 
386 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  29.35 
 
 
473 aa  59.7  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  29.65 
 
 
473 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  27.98 
 
 
469 aa  59.3  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.71 
 
 
337 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  26.01 
 
 
419 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  30.71 
 
 
506 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  30.67 
 
 
528 aa  58.5  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  28.43 
 
 
397 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  30.13 
 
 
389 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  29.59 
 
 
526 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  28.47 
 
 
476 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  28.41 
 
 
389 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.82 
 
 
375 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0519  serine endoprotease  23.5 
 
 
383 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  30 
 
 
461 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  29.14 
 
 
380 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  28.24 
 
 
501 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.65 
 
 
397 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  30.99 
 
 
528 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  28.41 
 
 
389 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  33.08 
 
 
397 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  31.68 
 
 
399 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  30.77 
 
 
493 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  28.72 
 
 
394 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  30.28 
 
 
527 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  26.92 
 
 
397 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  30.07 
 
 
476 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1139  serine endoprotease  23.5 
 
 
362 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.46983  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0455  serine endoprotease  23.5 
 
 
362 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000102083  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  27.94 
 
 
505 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  27.78 
 
 
497 aa  56.6  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.08 
 
 
385 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  25.13 
 
 
502 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  30.07 
 
 
490 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  30.99 
 
 
528 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3801  serine endoprotease  25.37 
 
 
354 aa  56.6  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  28.96 
 
 
485 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.24 
 
 
391 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  28.41 
 
 
383 aa  56.2  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.6 
 
 
381 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  29.33 
 
 
502 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  30.49 
 
 
520 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  26.52 
 
 
382 aa  56.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  27.96 
 
 
482 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  31.93 
 
 
392 aa  55.8  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  30.34 
 
 
462 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  28.29 
 
 
388 aa  55.5  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.32 
 
 
399 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  28.06 
 
 
498 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  28.57 
 
 
483 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  28.47 
 
 
457 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.57 
 
 
395 aa  55.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  25.57 
 
 
386 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  28.57 
 
 
483 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  29.17 
 
 
464 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  27.59 
 
 
461 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  29.02 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  28.31 
 
 
370 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  28.57 
 
 
483 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  28.48 
 
 
474 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.59 
 
 
435 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  30.34 
 
 
472 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  28.47 
 
 
466 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  28.77 
 
 
494 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.87 
 
 
386 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  27.22 
 
 
420 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  29.03 
 
 
508 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  28.57 
 
 
495 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  28.57 
 
 
495 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  25 
 
 
499 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  29.45 
 
 
495 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  30.36 
 
 
377 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  28.25 
 
 
459 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  25.93 
 
 
472 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  28.57 
 
 
495 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>