More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3448 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  100 
 
 		 495 aa  991    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  47.64 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  47.81 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  46.43 
 
 		 515 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0190  Na+/solute symporter  48.1 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0470055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  47.5 
 
 		 486 aa  428  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  46.8 
 
 		 479 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  46.22 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  45.53 
 
 		 492 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  44.42 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  46.71 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0212  sodium/solute symporter  48.02 
 
 		 475 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.200787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  44.47 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  44.51 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  45.13 
 
 		 479 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  39.96 
 
 		 461 aa  333  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5240  Na+/solute symporter  37.2 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0122  Na+/solute symporter  35.13 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00309864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  26.55 
 
 		 472 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1911  Na+/solute symporter  28.4 
 
 		 460 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.504205  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.91 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  27.62 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.36 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.14 
 
 		 461 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  28 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  28.64 
 
 		 463 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  28.44 
 
 		 462 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  28.12 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  26.12 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.69 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  30.16 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  30.16 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  27.47 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.84 
 
 		 500 aa  103  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4206  Na+/solute symporter  27.92 
 
 		 490 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153775  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  28.57 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.29 
 
 		 510 aa  98.2  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  29.09 
 
 		 459 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  23.23 
 
 		 486 aa  97.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.4 
 
 		 506 aa  95.9  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.01 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  26.8 
 
 		 462 aa  94  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  24.75 
 
 		 524 aa  92.8  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.19 
 
 		 460 aa  91.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.81 
 
 		 526 aa  90.5  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  26.57 
 
 		 508 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0924  twin-arginine translocation pathway signal  26.97 
 
 		 452 aa  87.8  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.839391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  28.21 
 
 		 492 aa  87.4  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0815  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 507 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215377  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  25.93 
 
 		 499 aa  86.7  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.11 
 
 		 493 aa  86.7  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  24.71 
 
 		 487 aa  86.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.63 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1525  Na+/solute symporter  24.39 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1333  Na+/solute symporter  23.52 
 
 		 466 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000174463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  24.88 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.52 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.12 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0649  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0662  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0913668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0642  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  23.69 
 
 		 638 aa  84  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.42 
 
 		 464 aa  83.2  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  24.45 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  27.08 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  23.3 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  24.42 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  26.23 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  25.46 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  24.14 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  25.49 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  26.24 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  23.95 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  26.51 
 
 		 587 aa  76.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0694  hypothetical protein  22.78 
 
 		 958 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1072  Na+/solute symporter  24.17 
 
 		 527 aa  76.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0387059  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  24 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  27.45 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  24.82 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.01 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.55 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.43 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  24.16 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04330  Na+/proline symporter  27.55 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.723621  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  24.48 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07840  sodium/ prolin symporter  24.69 
 
 		 544 aa  73.2  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.36 
 
 		 533 aa  72.8  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50026  predicted protein  32.63 
 
 		 741 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.301248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  24.36 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  23.89 
 
 		 494 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  25.56 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2930  sodium/proline symporter  24.34 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0527151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  26.22 
 
 		 585 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1444  hypothetical protein  25 
 
 		 1170 aa  72  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  24.08 
 
 		 498 aa  71.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  24.74 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  24.74 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  24.74 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  24.7 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>