More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0637 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  82.91 
 
 
399 aa  711    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  83.97 
 
 
395 aa  707    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  81.06 
 
 
399 aa  694    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 
398 aa  800    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.56 
 
 
410 aa  229  8e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0847  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.29 
 
 
413 aa  207  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.359888  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1823  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.6 
 
 
369 aa  192  7e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.248504  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.41 
 
 
431 aa  192  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.06 
 
 
423 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.06 
 
 
439 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.33 
 
 
433 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1982  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.81 
 
 
376 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.69 
 
 
423 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.97 
 
 
435 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.48 
 
 
413 aa  167  4e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.54 
 
 
442 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1109  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.39 
 
 
409 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330284  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.15 
 
 
409 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0775  hypothetical protein  31.13 
 
 
409 aa  153  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0167319  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.67 
 
 
419 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1422  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.66 
 
 
423 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  30.71 
 
 
422 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.19 
 
 
423 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.17 
 
 
407 aa  147  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.17 
 
 
419 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.17 
 
 
419 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  30.92 
 
 
411 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.58 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1162  peptidase M20  29.73 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.988314  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.1 
 
 
411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  30.45 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.84 
 
 
422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  30.25 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2108  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.67 
 
 
430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0921136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0353  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.99 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117081  hitchhiker  0.0085825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  33.16 
 
 
422 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  27 
 
 
407 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4390  peptidase M20  29.51 
 
 
413 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  29.58 
 
 
396 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  29.63 
 
 
422 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  27.75 
 
 
364 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  32.31 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  26.91 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  30.96 
 
 
424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3143  peptidase M20  30.22 
 
 
424 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.138788  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.62 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3470  peptidase M20  30.22 
 
 
424 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3273  hypothetical protein  31.92 
 
 
424 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.425351  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  29.07 
 
 
415 aa  132  9e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  29.7 
 
 
422 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  29.78 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  25.6 
 
 
407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  29.46 
 
 
422 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  29.46 
 
 
422 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  29.46 
 
 
422 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  27.16 
 
 
406 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  28.54 
 
 
422 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.68 
 
 
411 aa  129  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  29.46 
 
 
422 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  29.53 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  28.78 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  30.38 
 
 
424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  27.04 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  27.68 
 
 
446 aa  127  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.71 
 
 
433 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.3 
 
 
396 aa  126  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  29.24 
 
 
393 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  26.43 
 
 
415 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  27.82 
 
 
419 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.01 
 
 
391 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  30.89 
 
 
394 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  28.96 
 
 
391 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  28.46 
 
 
384 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  28.78 
 
 
422 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.14 
 
 
429 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  29.79 
 
 
388 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  29.85 
 
 
365 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  30.41 
 
 
400 aa  123  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.54 
 
 
400 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  28.97 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  27.99 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  28.36 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  28.71 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  28.46 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.84 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  26.5 
 
 
382 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.76 
 
 
393 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  27.82 
 
 
386 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  28.71 
 
 
386 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  30.15 
 
 
420 aa  121  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  27.57 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  27.63 
 
 
395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.5 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  26.06 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  29.65 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  27.18 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.97 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  27.89 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>