154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0622 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0622  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0795  hypothetical protein  32.46 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30208  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1591  putative lipase transmembrane protein  31.72 
 
 
294 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4427  lipase class 2  32.83 
 
 
298 aa  96.3  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5983  PGAP1 family protein  33.17 
 
 
313 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1765  PGAP1 family protein  33.79 
 
 
284 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1837  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like  30.26 
 
 
334 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000537235  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0697  PGAP1 family protein  29.39 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190659  normal  0.0587452 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0366  PGAP1 family protein  31.25 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.971571  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4060  alpha/beta hydrolase fold acetyltransferase  34.81 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3549  lipase, class 2  29.23 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.719928  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3386  lipase class 2  28.71 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220842  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4177  PGAP1 family protein  33.7 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2082  putative lipase transmembrane protein  29.77 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4204  PGAP1 family protein  33.7 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.562909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0506  PGAP1 family protein  26.22 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4194  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  30.48 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0648  PGAP1-like  34.95 
 
 
356 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00162479  normal  0.67184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  26.34 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2727  lipase class 2  28.98 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  28 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5039  lipase, class 2  29.27 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3898  lipase class 2  29.75 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  31 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  26.8 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2289  lipase, class 2  27.16 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1358  PGAP1 family protein  31.17 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3948  lipase class 2  29.11 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.759031  hitchhiker  0.00661405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  29.44 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2233  PGAP1 family protein  27.14 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.341698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  29.89 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0705  lipase-like protein  26.7 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.277877  hitchhiker  0.000332189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0942  putative lipase transmembrane protein  29.86 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0517  PGAP1 family protein  31.08 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.678836  normal  0.0127605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0349  putative lipase transmembrane protein  28.57 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0533  PGAP1 family protein  31.08 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3012  lipase class 2  26.55 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1910  PGAP1 family protein  28.26 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1861  lipase class 2  28.37 
 
 
286 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0020609  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0929  lipase family protein  30.05 
 
 
195 aa  62.4  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0435  putative lipase transmembrane protein  26.7 
 
 
302 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4226  lipase class 2  25.89 
 
 
342 aa  62.4  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.522667  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6546  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  31.93 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000180177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4221  putative lipase transmembrane protein  27.18 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.617519  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  24.59 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1162  lipase, class 2  25.41 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128789  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  25.84 
 
 
222 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4259  PGAP1 family protein  26.04 
 
 
194 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1051  lipase, class 2  24.02 
 
 
282 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.199971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0516  lipase class 2  25.93 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1112  lipase class 2  24.88 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0582  lipase class 2  26.86 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06481  lipase family protein  25.44 
 
 
203 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3323  lipase-like  28.18 
 
 
211 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4244  putative lipase transmembrane protein  28.29 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3632  PGAP1 family protein  24.34 
 
 
191 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2532  PGAP1 family protein  29.71 
 
 
547 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.990857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1159  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1164  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2455  lipase, putative  24.49 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4732  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0017589 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1726  hypothetical protein  27.1 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120818  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4854  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0143781 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06181  lipase family protein  24.06 
 
 
203 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  29.95 
 
 
269 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1184  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.07 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1266  PGAP1 family protein  26.67 
 
 
332 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0709  lipase class 2  22.95 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.876817  normal  0.295247 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0592  lipase family protein  26.09 
 
 
197 aa  52.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.320367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3293  triacylglycerol lipase  29.55 
 
 
364 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.435156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2975  lipase, putative  30.33 
 
 
254 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4646  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.83361  normal  0.059951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0301  hypothetical protein  28.97 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2031  PGAP1 family protein  26.39 
 
 
442 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63620  lipase LipC  30.87 
 
 
309 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1495  hypothetical protein  30.77 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2173  triacylglycerol lipase  26.92 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162824  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4451  triacylglycerol lipase  29.23 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3915  triacylglycerol lipase  29.23 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531822  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3809  triacylglycerol lipase  28.79 
 
 
364 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.474224  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4668  triacylglycerol lipase  29.27 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.184422  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3612  triacylglycerol lipase  29.23 
 
 
364 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3739  PGAP1 family protein  24.11 
 
 
415 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2080  lipase  30.4 
 
 
367 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3796  triacylglycerol lipase  28.21 
 
 
377 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1107  lipase  30.4 
 
 
367 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06571  lipase family protein  23.47 
 
 
197 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1386  lipase  30.4 
 
 
367 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2371  lipase  30.4 
 
 
367 aa  49.7  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0739  Triacylglycerol lipase  25.98 
 
 
332 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0272  hypothetical protein  29.91 
 
 
216 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.937595  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27100  lactonizing lipase precursor  29.51 
 
 
311 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0809  Triacylglycerol lipase  27.12 
 
 
332 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0610177  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1028  lipase family protein  31.78 
 
 
191 aa  49.3  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.508866  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3071  Alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
289 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1082  lipase class 2  22.87 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18471  lipase family protein  27.84 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.812999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2914  putative alpha/beta hydrolase  29.46 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0274125  normal  0.502699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
365 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.015402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06840  alpha/beta hydrolase fold protein with lipase active site  32.37 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>