140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0855 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0855  putative cyclase  100 
 
 		 262 aa  543  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.848747  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3207  cyclase, putative  85.38 
 
 		 260 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2398  cyclase family protein  67.45 
 
 		 263 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.815528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3414  cyclase family protein  62.85 
 
 		 262 aa  351  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2038  putative cyclase  62.79 
 
 		 260 aa  351  8.999999999999999e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.17281  normal  0.51893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4826  cyclase family protein  63.81 
 
 		 271 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.594679 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0716  putative cyclase  63.78 
 
 		 259 aa  345  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0101  cyclase family protein  61.45 
 
 		 268 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0387  cyclase family protein  58.4 
 
 		 268 aa  338  7e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0417  cyclase family protein  60.94 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.421227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5979  putative cyclase  61.26 
 
 		 258 aa  332  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3149  cyclase family protein  60 
 
 		 259 aa  328  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.568603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1005  cyclase family protein  57.53 
 
 		 266 aa  321  8e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.70726 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7460  putative cyclase  57.2 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4646  cyclase family protein  58.66 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1793  putative cyclase  56.49 
 
 		 267 aa  317  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.675258  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5611  putative cyclase  57.59 
 
 		 268 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5975  cyclase family protein  57.59 
 
 		 268 aa  315  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00514235  decreased coverage  0.000132794 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1225  putative cyclase  59.06 
 
 		 262 aa  315  7e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  55.95 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0480  putative cyclase  51.57 
 
 		 261 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2548  cyclase family protein  46.85 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2300  cyclase family protein  46.06 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.408163 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1541  cyclase family protein  45.67 
 
 		 253 aa  215  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.711446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2245  putative cyclase  44.74 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3459  cyclase family protein  41.35 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  42.13 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1493  cyclase family protein  42.47 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.778489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2646  putative cyclase  40 
 
 		 270 aa  198  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1543  cyclase family protein  42.41 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.874935  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  39.06 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4390  putative cyclase  39.07 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  26.07 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  31.9 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  30.43 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  29.67 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2320  putative cyclase  27.3 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000962152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  29.85 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  28.86 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  28.95 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.32 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  26.63 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  25.21 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  24.79 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  24.79 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  24.79 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  24.79 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  29.35 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  25.74 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  25.74 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  25.93 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  27.94 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  24.79 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  28.23 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  27.23 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.74 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  27.37 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  28 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  25.81 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  33.33 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0042  putative cyclase  28.64 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.836357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3621  cyclase family protein  25.58 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0367  putative cyclase  26.72 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  23.38 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  26.61 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  28.33 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  26.29 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2377  cyclase family protein  25.44 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.359406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.47 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  29.41 
 
 		 216 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  26.18 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  27.15 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2407  putative cyclase  29.25 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0264873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2733  cyclase family protein  26.61 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3501  putative cyclase  25 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  25.48 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5006  cyclase family protein  26.47 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  27.59 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5058  cyclase family protein  30.53 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  29.03 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  33.11 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  28.96 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  24.1 
 
 		 214 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  25.37 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  23.94 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  28.38 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0925  cyclase family protein  26.15 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  24.88 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  25.7 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  25.7 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  25.89 
 
 		 214 aa  48.5  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  25.66 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  28.77 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1259  cyclase family protein  26.24 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.240385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1127  cyclase family protein  19.5 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0414  cyclase family protein  23.08 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  28.28 
 
 		 214 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  24.64 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  32.31 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  32.14 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0579739 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>