225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3907 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3907  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  100 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5062  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  69.42 
 
 
296 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000399441  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5624  intradiol ring-cleavage dioxygenase  67.97 
 
 
293 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.187474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3378  intradiol ring-cleavage dioxygenase  66.19 
 
 
290 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49834  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  67.26 
 
 
309 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5216  intradiol ring-cleavage dioxygenase  65.84 
 
 
290 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763537  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2064  catechol 1,2-dioxygenase  48.42 
 
 
279 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00741411  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3333  catechol 1,2-dioxygenase  48.97 
 
 
293 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12775  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0834  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.81 
 
 
294 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5063  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.37 
 
 
309 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6138  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.97 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0908917  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4137  catechol 1,2-dioxygenase  48.6 
 
 
301 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.82 
 
 
300 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5533  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.52 
 
 
295 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.247277  hitchhiker  0.00000648247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1327  intradiol ring-cleavage dioxygenase  49.83 
 
 
293 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.377369 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  49.13 
 
 
287 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1587  catechol 1,2-dioxygenase  47.35 
 
 
276 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7443  dioxygenase  47.89 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.544138  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  48.81 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4613  catechol 1,2-dioxygenase  47.9 
 
 
290 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5310  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  46.37 
 
 
289 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123777  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  49.41 
 
 
299 aa  242  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5728  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  47.02 
 
 
283 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2816  putative catechol 1,2-dioxygenase  45.99 
 
 
306 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00764  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14270)  43.66 
 
 
329 aa  239  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09363  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 
334 aa  235  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0417732 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4569  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.03 
 
 
304 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.471867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3255  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.26 
 
 
301 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3196  catechol 1,2-dioxygenase  44.91 
 
 
303 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.42127  normal  0.302441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4340  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.58 
 
 
287 aa  232  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.362809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.69 
 
 
301 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.83 
 
 
303 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0357  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46 
 
 
288 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.43889 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2210  catechol 1,2-dioxygenase  44.76 
 
 
302 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0438906  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4404  intradiol ring-cleavage dioxygenase  45.39 
 
 
297 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128185  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5652  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  43.14 
 
 
306 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0157172  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62287  6-chlorohydroxyquinol-1,2-dioxygenase  38.73 
 
 
328 aa  215  7e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  42.18 
 
 
300 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04532  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  40.38 
 
 
295 aa  204  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00712197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4739  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.55 
 
 
312 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3458  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.02 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52208  hydroxyquinol 1,2- dioxygenase  38.08 
 
 
311 aa  199  5e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.833687  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08998  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02910)  38.21 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5041  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.81 
 
 
296 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193413  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5855  intradiol ring-cleavage dioxygenase:catechol dioxygenase, N-terminal  37.89 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8639  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.03 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591045  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1912  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.25 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7639  catechol 1,2-dioxygenase  38.19 
 
 
297 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1782  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.86 
 
 
287 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0988363  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3128  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.76 
 
 
317 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.886792 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5541  intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.44 
 
 
287 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000749052  hitchhiker  0.0000194786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0205  intradiol ring-cleavage dioxygenase  39.41 
 
 
275 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08566  catechol dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03030)  35.59 
 
 
313 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476147  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1328  catechol 1,2-dioxygenase  36.36 
 
 
313 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.27374  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2372  catechol 1,2-dioxygenase  35.04 
 
 
309 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1705  catechol dioxygenase, N-terminal  34.91 
 
 
305 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  34.07 
 
 
305 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4028  catechol 1,2-dioxygenase  34.15 
 
 
300 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2152  catechol 1,2-dioxygenase  32.4 
 
 
302 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0484  catechol 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 
300 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2567  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 
304 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2711  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 
304 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999962  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0987  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 
300 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2109  catechol 1,2-dioxygenase (CatA)  33.46 
 
 
302 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3754  catechol 1,2-dioxygenase  33.7 
 
 
300 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407559  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4594  catechol 1,2-dioxygenase  33.7 
 
 
300 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3769  catechol 1,2-dioxygenase  33.7 
 
 
300 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0354722  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0199  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0230  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1374  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19416  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1571  catechol 1,2-dioxygenase  33.21 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.964225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2732  catechol 1,2-dioxygenase  37.13 
 
 
310 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4961  catechol 1,2-dioxygenase  32.96 
 
 
300 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  32.59 
 
 
300 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5498  catechol 1,2-dioxygenase  31.85 
 
 
300 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32240  catechol 1,2-dioxygenase  36.4 
 
 
310 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3661  catechol 1,2-dioxygenase  31.85 
 
 
300 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.245457  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3713  catechol 1,2-dioxygenase  33.94 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0936844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2206  catechol 1,2-dioxygenase  34.51 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.400147  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  35.48 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2055  catechol 1,2-dioxygenase  33.94 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2703  catechol 1,2-dioxygenase  35.04 
 
 
304 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.49188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0977  catechol 1,2-dioxygenase  33.81 
 
 
310 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.705538  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4881  Catechol 1,2-dioxygenase  34.04 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.494696 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4357  catechol 1,2-dioxygenase  30.69 
 
 
304 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3040  catechol 1,2-dioxygenase  31.54 
 
 
305 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2683  catechol 1,2-dioxygenase  33.94 
 
 
304 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1268  catechol 1,2-dioxygenase  31.05 
 
 
307 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.304103  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3166  catechol 1,2-dioxygenase  33.45 
 
 
304 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796964  normal  0.601701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1867  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.74 
 
 
304 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416539  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2961  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.27 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2327  catechol 1,2-dioxygenase  34.7 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2549  catechol 1,2-dioxygenase  33.96 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.806201  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0142  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.29 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.38162  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0160  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.29 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1133  catechol 1,2-dioxygenase  31.99 
 
 
308 aa  133  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  31.05 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4402  catechol dioxygenase, N-terminal  31.72 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1427  catechol 1,2-dioxygenase  30.91 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.322187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2116  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.74 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.160413  normal  0.283924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>