93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4700 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_4700  predicted protein  100 
 
 		 325 aa  670    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60243  predicted protein  31.73 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.573964  normal  0.330306 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04317  Protein transport protein sec13 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B563]  28.7 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24996  predicted protein  29.82 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.073131  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76043  predicted protein  26.67 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.334358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03320  vesicle budding-related protein, putative  27.99 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443971  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17465  predicted protein  28.74 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00270  nuclear pore protein seh1, putative  32.7 
 
 		 399 aa  97.1  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0000774214  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05889  WD40 protein related to S. cerevisiae SEH1 (Eurofung)  26.12 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442783  normal  0.746893 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16850  predicted protein  26.83 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.230091  normal  0.492829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.76 
 
 		 1217 aa  55.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.39 
 
 		 630 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.61 
 
 		 865 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.2 
 
 		 682 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.77 
 
 		 806 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  29.17 
 
 		 1766 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1552 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  27.7 
 
 		 405 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9020  predicted protein  23.97 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.18 
 
 		 919 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1491 aa  49.7  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.71 
 
 		 737 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  23.9 
 
 		 1344 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  27.44 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.29 
 
 		 696 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43665  predicted protein  22.8 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  35.53 
 
 		 1183 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.06 
 
 		 1357 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.21 
 
 		 1262 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.78 
 
 		 1609 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.17 
 
 		 828 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 833 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  34.88 
 
 		 1901 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  31.65 
 
 		 840 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.61 
 
 		 1348 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.27 
 
 		 675 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 		 1161 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.89 
 
 		 1656 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 		 1161 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.93 
 
 		 1617 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  22.74 
 
 		 1661 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.78 
 
 		 1652 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  35.06 
 
 		 577 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.84 
 
 		 924 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1363 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  26.71 
 
 		 1208 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.19 
 
 		 740 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.34 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.39 
 
 		 1163 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  31.25 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.86 
 
 		 1684 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  29.87 
 
 		 1474 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17948  chromatin assembly factor subunit c  24.28 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.446667  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  27.94 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 1221 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.17 
 
 		 1510 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8842  predicted protein  21.51 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1477 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.36 
 
 		 1256 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.76 
 
 		 1481 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  27.5 
 
 		 652 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1041 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04270  conserved hypothetical protein  30.99 
 
 		 820 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.302416  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 		 523 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  19.68 
 
 		 1557 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 		 1164 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  37.18 
 
 		 1264 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1858 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  37.18 
 
 		 1264 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  25.88 
 
 		 564 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.14 
 
 		 574 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1209 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31.51 
 
 		 1304 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.9 
 
 		 1831 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 		 1190 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.76 
 
 		 898 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.67 
 
 		 1267 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.08 
 
 		 1193 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  32.47 
 
 		 954 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45580  coronin like protein  25.69 
 
 		 450 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  21.91 
 
 		 1247 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  31.65 
 
 		 484 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  33.72 
 
 		 872 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.1 
 
 		 1599 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  26.03 
 
 		 1334 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1553 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 1039 aa  42.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.15 
 
 		 657 aa  42.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1807 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.74 
 
 		 576 aa  42.4  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28024  predicted protein  28.28 
 
 		 373 aa  42.4  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.641844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1214 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>