143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_28024 on replicon NC_009370
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009370  OSTLU_28024  predicted protein  100 
 
 
373 aa  733    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.641844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.45 
 
 
696 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.5 
 
 
676 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.19 
 
 
1363 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.79 
 
 
1163 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  26.34 
 
 
484 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  24.38 
 
 
782 aa  61.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.03 
 
 
1623 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.17 
 
 
1831 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.47 
 
 
1652 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.45 
 
 
1367 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04460  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07540)  25.49 
 
 
977 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.693918  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.37 
 
 
1474 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.29 
 
 
1161 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.29 
 
 
1161 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.42 
 
 
947 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 
344 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.18 
 
 
1193 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.2 
 
 
740 aa  56.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.41 
 
 
742 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.56 
 
 
1807 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.89 
 
 
1557 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  27.54 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  30.48 
 
 
1280 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  28.17 
 
 
564 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  31.18 
 
 
443 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.27 
 
 
1901 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.43 
 
 
1039 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  28.02 
 
 
316 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.21 
 
 
1304 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  24.72 
 
 
1208 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.7 
 
 
1357 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.72 
 
 
865 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00305  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit Dip2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02680)  30.51 
 
 
963 aa  52.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140894  normal  0.864535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.61 
 
 
919 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.88 
 
 
1411 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  29.92 
 
 
1100 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  27.81 
 
 
505 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.83 
 
 
1221 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.12 
 
 
1196 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  27.99 
 
 
1427 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.88 
 
 
1236 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  31.09 
 
 
872 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.88 
 
 
1858 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  24.9 
 
 
1599 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.59 
 
 
698 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.74 
 
 
1262 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.76 
 
 
716 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.19 
 
 
1164 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.01 
 
 
574 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  33.65 
 
 
418 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.12 
 
 
1553 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  29.44 
 
 
1766 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.7 
 
 
344 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  20.85 
 
 
1868 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  28.81 
 
 
522 aa  49.7  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.89 
 
 
1214 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  23.87 
 
 
1373 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  24.5 
 
 
657 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 
1686 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  31.11 
 
 
1491 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.66 
 
 
630 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49529  predicted protein  25.28 
 
 
846 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.135063  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05910  hypothetical protein  25 
 
 
949 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.74 
 
 
1240 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.05 
 
 
1481 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.36 
 
 
664 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36759  protein required for amino acid permease transport from the Golgi to the cell surface  29.41 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.94 
 
 
1443 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1188 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  23.78 
 
 
922 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.75 
 
 
1217 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.02 
 
 
576 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  26.29 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.73 
 
 
828 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.82 
 
 
1209 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.9 
 
 
1609 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18258  predicted protein  28.67 
 
 
743 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175044  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01387  meiotic recombination protein Ski8/Rec14, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08860)  27.67 
 
 
306 aa  47  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000649458  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.17 
 
 
833 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.08 
 
 
1598 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03370  ubiquitin-protein ligase, putative  29.39 
 
 
928 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.307571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.45 
 
 
1552 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.86 
 
 
924 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.47 
 
 
1583 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  21.28 
 
 
389 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10058  ribosome biogenesis protein Rsa4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01990)  29.03 
 
 
518 aa  46.2  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00160537  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 
728 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.53 
 
 
1247 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06197  Nuclear distribution protein nudF [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00664]  27.46 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.992518 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.51 
 
 
1364 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.11 
 
 
1617 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05200  WD-repeat protein, putative  29.73 
 
 
988 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.15 
 
 
1789 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.08 
 
 
642 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  27.01 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  29.32 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  25.86 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  29.32 
 
 
363 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.61 
 
 
930 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>