121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60243 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_60243  predicted protein  100 
 
 		 356 aa  737    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.573964  normal  0.330306 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_4700  predicted protein  31.82 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00270  nuclear pore protein seh1, putative  27.3 
 
 		 399 aa  142  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0000774214  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76043  predicted protein  30.7 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.334358  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05889  WD40 protein related to S. cerevisiae SEH1 (Eurofung)  28.93 
 
 		 342 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442783  normal  0.746893 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24996  predicted protein  28.91 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.073131  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03320  vesicle budding-related protein, putative  29.66 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443971  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04317  Protein transport protein sec13 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B563]  29.05 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17465  predicted protein  25.16 
 
 		 294 aa  99.8  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.55 
 
 		 1213 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.08 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.61 
 
 		 1831 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.37 
 
 		 1686 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.44 
 
 		 1477 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1807 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.77 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1714 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.78 
 
 		 1652 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.15 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  22.93 
 
 		 1858 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.31 
 
 		 1901 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.16 
 
 		 1363 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.6 
 
 		 1510 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  23.36 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00880  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 7 (Eurofung)  31.41 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.619902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.34 
 
 		 1661 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.76 
 
 		 1481 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.6 
 
 		 1553 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.29 
 
 		 1163 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  22.22 
 
 		 1164 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.8 
 
 		 1552 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  22.12 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16850  predicted protein  22.15 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.230091  normal  0.492829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.91 
 
 		 1598 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.25 
 
 		 1229 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.56 
 
 		 1711 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  22.5 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  22.99 
 
 		 1264 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  22.99 
 
 		 1264 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.99 
 
 		 1607 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.33 
 
 		 1547 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  25.62 
 
 		 511 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.24 
 
 		 1161 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.24 
 
 		 1161 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  35.71 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  17.87 
 
 		 1177 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.27 
 
 		 1623 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.69 
 
 		 737 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 		 1443 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.12 
 
 		 1236 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1304 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  20.95 
 
 		 1789 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43665  predicted protein  24.14 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  21.85 
 
 		 1357 aa  49.7  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 1221 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  22.7 
 
 		 1217 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.58 
 
 		 1599 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  30.34 
 
 		 1176 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.6 
 
 		 1760 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.88 
 
 		 630 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.55 
 
 		 1209 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  32.53 
 
 		 652 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03785  component of the chromatin assembly complex (Eurofung)  37.04 
 
 		 684 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.75 
 
 		 1583 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.59 
 
 		 664 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.37 
 
 		 1039 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.91 
 
 		 806 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  24.31 
 
 		 1656 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  23.29 
 
 		 1878 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  28.68 
 
 		 495 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.5 
 
 		 1188 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.28 
 
 		 1474 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0384  WD-40 repeat-containing protein  20.42 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.34 
 
 		 1609 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  23.1 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.53 
 
 		 947 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  22.54 
 
 		 316 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.35 
 
 		 1267 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  21.78 
 
 		 1193 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1196 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.18 
 
 		 642 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.67 
 
 		 1364 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.94 
 
 		 1823 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  23.76 
 
 		 1348 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.67 
 
 		 1398 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05450  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 		 523 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.723357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.93 
 
 		 676 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60492  predicted protein  29.9 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89595  predicted protein  34.57 
 
 		 503 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.136395 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  22.22 
 
 		 1262 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  30.43 
 
 		 1183 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9020  predicted protein  32.61 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44047  predicted protein  34.52 
 
 		 463 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.298129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  22.94 
 
 		 1279 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  21.52 
 
 		 1344 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  22.94 
 
 		 1279 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.69 
 
 		 576 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49918  WD-repeat protein required for cell viability  26.97 
 
 		 520 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  34.02 
 
 		 1041 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>