29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_05889 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05889  WD40 protein related to S. cerevisiae SEH1 (Eurofung)  100 
 
 
342 aa  709    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442783  normal  0.746893 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60243  predicted protein  28.93 
 
 
356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.573964  normal  0.330306 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00270  nuclear pore protein seh1, putative  33.12 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0000774214  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_4700  predicted protein  25.75 
 
 
325 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04317  Protein transport protein sec13 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B563]  25.42 
 
 
309 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76043  predicted protein  25.1 
 
 
302 aa  52.8  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.334358  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.68 
 
 
1807 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24996  predicted protein  23.85 
 
 
330 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.073131  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17465  predicted protein  25.61 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.94 
 
 
1626 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.65 
 
 
1617 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  34.18 
 
 
1714 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  31.03 
 
 
1183 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.89 
 
 
1599 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0818  WD-40 repeat-containing protein  28.17 
 
 
834 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.03 
 
 
1652 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.31 
 
 
1686 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 
1247 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03320  vesicle budding-related protein, putative  23.51 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  34.21 
 
 
1443 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  29.17 
 
 
1164 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 
1398 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.56 
 
 
1547 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  32.89 
 
 
922 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.14 
 
 
1623 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.37 
 
 
1711 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  32.05 
 
 
1424 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  33.93 
 
 
363 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.94 
 
 
1760 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>