33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00270 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB00270  nuclear pore protein seh1, putative  100 
 
 		 399 aa  801    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0000774214  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60243  predicted protein  27.56 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.573964  normal  0.330306 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_4700  predicted protein  32.7 
 
 		 325 aa  97.8  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05889  WD40 protein related to S. cerevisiae SEH1 (Eurofung)  33.12 
 
 		 342 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442783  normal  0.746893 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04317  Protein transport protein sec13 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B563]  31.69 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.453021 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76043  predicted protein  42.68 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.334358  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03320  vesicle budding-related protein, putative  26.67 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.443971  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24996  predicted protein  32.12 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.073131  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17465  predicted protein  29.01 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  22.72 
 
 		 1656 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.52 
 
 		 1161 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.28 
 
 		 1161 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.93 
 
 		 1236 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  22.74 
 
 		 1552 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.77 
 
 		 1684 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.09 
 
 		 1213 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.41 
 
 		 1686 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  21.2 
 
 		 1858 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.61 
 
 		 1652 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.41 
 
 		 1547 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.18 
 
 		 1607 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.47 
 
 		 1609 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1599 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  22.39 
 
 		 1661 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.06 
 
 		 1583 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.32 
 
 		 1623 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.99 
 
 		 1398 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.94 
 
 		 1598 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  42.86 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.41 
 
 		 1626 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  31.91 
 
 		 1901 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.8 
 
 		 1163 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.3 
 
 		 1217 aa  42.7  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>