182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44767 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  100 
 
 		 1557 aa  3204    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  38.01 
 
 		 1629 aa  281  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  39.16 
 
 		 1649 aa  268  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  38.13 
 
 		 1697 aa  261  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1652 aa  219  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1474 aa  196  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  30.94 
 
 		 1490 aa  179  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  29.06 
 
 		 1622 aa  171  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  30.77 
 
 		 1523 aa  167  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  29.64 
 
 		 1630 aa  165  5.0000000000000005e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  29.13 
 
 		 1489 aa  161  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  30.77 
 
 		 1387 aa  149  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  27.25 
 
 		 1790 aa  147  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1724 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  32 
 
 		 1575 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  30.47 
 
 		 2622 aa  142  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  31.53 
 
 		 1410 aa  139  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  30.35 
 
 		 1694 aa  138  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  31.49 
 
 		 905 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  30.81 
 
 		 907 aa  127  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  31.56 
 
 		 900 aa  127  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  30.7 
 
 		 905 aa  126  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  30.94 
 
 		 905 aa  125  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  31.11 
 
 		 905 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  31.11 
 
 		 905 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  29.47 
 
 		 1121 aa  118  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  32.21 
 
 		 1296 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  30.25 
 
 		 908 aa  111  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  27.37 
 
 		 1823 aa  110  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  31.31 
 
 		 1363 aa  110  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  28.07 
 
 		 903 aa  104  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  28.42 
 
 		 1328 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  28.53 
 
 		 1622 aa  101  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  30.42 
 
 		 906 aa  99.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1722 aa  99.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  26.9 
 
 		 1980 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  26.89 
 
 		 2045 aa  97.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.45 
 
 		 1196 aa  97.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1680 aa  97.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  26.42 
 
 		 1081 aa  96.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  27.82 
 
 		 2098 aa  92.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  27.82 
 
 		 2098 aa  92.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  26.96 
 
 		 2207 aa  91.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  28.92 
 
 		 1945 aa  91.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  26.49 
 
 		 1838 aa  91.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  26.27 
 
 		 1950 aa  91.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  26.33 
 
 		 1958 aa  90.9  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  26.82 
 
 		 1803 aa  90.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  26.2 
 
 		 1973 aa  90.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  28.4 
 
 		 2005 aa  89.4  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1822 aa  89  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 		 2101 aa  89  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 		 2101 aa  89  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 		 2098 aa  89  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.39 
 
 		 1203 aa  89  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  29.04 
 
 		 946 aa  88.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  26.83 
 
 		 2204 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  28.38 
 
 		 925 aa  88.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  28.21 
 
 		 2125 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  28.21 
 
 		 2125 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  28.31 
 
 		 1822 aa  86.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.38 
 
 		 1959 aa  86.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1888 aa  86.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  30.48 
 
 		 1559 aa  85.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 		 2104 aa  85.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  26.87 
 
 		 2197 aa  85.5  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  23.64 
 
 		 2759 aa  85.1  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0432  viral phosphatase  25.41 
 
 		 1285 aa  84.3  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1572 aa  84  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  28.19 
 
 		 914 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.77 
 
 		 1403 aa  82.8  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1904 aa  83.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  30.92 
 
 		 1986 aa  82.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  34.91 
 
 		 904 aa  82.4  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1801 aa  82.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  30.45 
 
 		 758 aa  82  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.23 
 
 		 932 aa  82  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  24.5 
 
 		 1867 aa  81.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  26.45 
 
 		 2002 aa  80.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  29.16 
 
 		 2013 aa  80.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  28.14 
 
 		 916 aa  80.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  28.83 
 
 		 606 aa  80.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1328 aa  79.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  24.62 
 
 		 1991 aa  79.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  29.08 
 
 		 2198 aa  78.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  25.44 
 
 		 1754 aa  77.8  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  31.96 
 
 		 2222 aa  78.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  25.93 
 
 		 1983 aa  78.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.04 
 
 		 1099 aa  78.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  24.53 
 
 		 1958 aa  78.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  29.33 
 
 		 922 aa  78.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  27.7 
 
 		 643 aa  78.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  26.22 
 
 		 2016 aa  76.3  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  26.6 
 
 		 635 aa  75.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  27.76 
 
 		 2096 aa  75.9  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  26.54 
 
 		 1593 aa  75.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  27.53 
 
 		 636 aa  75.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  28.53 
 
 		 2123 aa  75.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  26.57 
 
 		 632 aa  73.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1062 aa  72.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>