113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34196 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_34196  predicted protein  100 
 
 		 371 aa  770    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46231  predicted protein  26.83 
 
 		 557 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  27.08 
 
 		 836 aa  73.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.79 
 
 		 2145 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1404 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1550 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.81 
 
 		 1154 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.67 
 
 		 622 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28 
 
 		 1228 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  26.63 
 
 		 825 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1238 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  25.26 
 
 		 2327 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 949 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 		 1186 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  24.65 
 
 		 1040 aa  57.4  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  25.74 
 
 		 689 aa  57  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  24.15 
 
 		 694 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  24.05 
 
 		 822 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.29 
 
 		 764 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 		 771 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  24.07 
 
 		 1106 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 878 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  24.72 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.27 
 
 		 667 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  25 
 
 		 708 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 1406 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25 
 
 		 732 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 649 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  25.81 
 
 		 650 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.44 
 
 		 782 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 833 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43024  predicted protein  24.85 
 
 		 576 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000321984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.42 
 
 		 1328 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.13 
 
 		 955 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 		 1290 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  30.52 
 
 		 919 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 924 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 750 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.96 
 
 		 787 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 481 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.65 
 
 		 626 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.18 
 
 		 1162 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.65 
 
 		 626 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 637 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 3145 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1215 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  30.15 
 
 		 681 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.72 
 
 		 919 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.65 
 
 		 614 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.65 
 
 		 614 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 614 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 614 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 614 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.58 
 
 		 740 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.26 
 
 		 945 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.11 
 
 		 985 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1088 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1162 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 739 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  31.62 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.71 
 
 		 828 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 258 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1526 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 927 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 217 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.73 
 
 		 568 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 568 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 632 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  26.32 
 
 		 919 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 1025 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 909 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  24.49 
 
 		 686 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1039 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 885 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 991 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2220  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  35.05 
 
 		 1429 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.44 
 
 		 810 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.53 
 
 		 957 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 611 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  22.49 
 
 		 731 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48337  predicted protein  33.72 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 635 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 635 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 639 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 		 1288 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6656  serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 		 979 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.38837  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  22.67 
 
 		 725 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.88 
 
 		 2240 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4168  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 326 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42809  predicted protein  26.76 
 
 		 323 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767843  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  25.14 
 
 		 807 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.29 
 
 		 767 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  29.35 
 
 		 638 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.22 
 
 		 626 aa  43.9  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>