259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32830 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  100 
 
 		 393 aa  827    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  35.49 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  37.87 
 
 		 260 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05114  ribonuclease HI large subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G07600)  37.83 
 
 		 339 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  32.07 
 
 		 239 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  31.78 
 
 		 239 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  31.65 
 
 		 239 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  30.54 
 
 		 244 aa  94.7  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  29.67 
 
 		 277 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  32.17 
 
 		 213 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  30.22 
 
 		 212 aa  85.5  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  31.48 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  30.34 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  30 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  31.9 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  29.2 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  28.44 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  31.7 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  30.14 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  28.51 
 
 		 234 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  28.38 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  30.26 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  27.71 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  30.36 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  29.67 
 
 		 198 aa  68.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  29.69 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  25.79 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  25.93 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  30 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1505  ribonuclease H  28.16 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  28.76 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  30.36 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  29.73 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  29.47 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  29.46 
 
 		 232 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  33.74 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  30.96 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  26.05 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  33.13 
 
 		 229 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  29.63 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  28.33 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  32.35 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0912  ribonuclease HII  25.82 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.976691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  26.78 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  29.46 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  28.11 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  30.77 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  26.09 
 
 		 202 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  30.49 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  26.13 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  30.18 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  28.57 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1839  ribonuclease HII  29.67 
 
 		 196 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  26.13 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  28.23 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  27.68 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  26.13 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  29.5 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  27.92 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  32.93 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  28.02 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  26.32 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  26.32 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  25.68 
 
 		 198 aa  57  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  27.18 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  25.68 
 
 		 198 aa  57  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  25.68 
 
 		 198 aa  57  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  25.68 
 
 		 198 aa  57  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  25.68 
 
 		 198 aa  57  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  25.68 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  30.43 
 
 		 214 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  27.11 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  28.24 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  26.43 
 
 		 218 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  25.84 
 
 		 209 aa  55.1  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  27.89 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  27.39 
 
 		 217 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  26.84 
 
 		 208 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  27.39 
 
 		 217 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  29.02 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  25.66 
 
 		 257 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  28.25 
 
 		 207 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  25.31 
 
 		 240 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1923  ribonuclease HII  27.48 
 
 		 221 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  30.67 
 
 		 216 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  27.31 
 
 		 202 aa  53.5  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  32.16 
 
 		 267 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  27.31 
 
 		 202 aa  53.5  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  29.76 
 
 		 206 aa  53.5  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  26.79 
 
 		 210 aa  53.1  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  26.79 
 
 		 218 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  28.8 
 
 		 203 aa  53.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  26.49 
 
 		 207 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  26.22 
 
 		 213 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  29.06 
 
 		 230 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  27.35 
 
 		 207 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  25.11 
 
 		 198 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  26.89 
 
 		 184 aa  52.8  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  28.14 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  27.72 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>