More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18361 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 352 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  85.23 
 
 		 352 aa  630  1e-180  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  84.2 
 
 		 352 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  83.43 
 
 		 352 aa  617  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  84.2 
 
 		 352 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  82.76 
 
 		 351 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  71.8 
 
 		 346 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  72.38 
 
 		 346 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  71.22 
 
 		 346 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  70.64 
 
 		 346 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  69.08 
 
 		 353 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  67.43 
 
 		 354 aa  504  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  68.42 
 
 		 349 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  64.94 
 
 		 350 aa  495  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  65.13 
 
 		 354 aa  494  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  66.38 
 
 		 350 aa  497  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  65.99 
 
 		 354 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  65.99 
 
 		 354 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  54.6 
 
 		 409 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  55.36 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  53.89 
 
 		 321 aa  361  1e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  47.8 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  45.32 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  41.19 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  41.4 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  43.44 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  40.4 
 
 		 354 aa  265  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  36.02 
 
 		 342 aa  265  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 360 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  38.71 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5771  uroporphyrinogen decarboxylase  41.59 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 		 355 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  38.28 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66550  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  38.51 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  38.44 
 
 		 357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  37.69 
 
 		 341 aa  259  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  39.82 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  38.24 
 
 		 351 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  38.62 
 
 		 340 aa  259  7e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  39.29 
 
 		 348 aa  259  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.22 
 
 		 355 aa  258  7e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3929  uroporphyrinogen decarboxylase  42.47 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  39.52 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  39.71 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  38.12 
 
 		 351 aa  257  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  39.02 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  38.62 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 351 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45190  uroporphyrinogen decarboxylase  40.65 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0836  uroporphyrinogen decarboxylase  37.61 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41854  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  38.17 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  36.8 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  37.08 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0552  uroporphyrinogen decarboxylase  40.06 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147846 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  37.87 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0392  uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 354 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  36.05 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5124  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  37.88 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  38.17 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0415  uroporphyrinogen decarboxylase  39.47 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4947  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  37.86 
 
 		 402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  37.86 
 
 		 361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0609  uroporphyrinogen decarboxylase  39.41 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884937  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  37.91 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5074  uroporphyrinogen decarboxylase  38.51 
 
 		 354 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  36.5 
 
 		 353 aa  252  6e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2666  uroporphyrinogen decarboxylase  37.5 
 
 		 354 aa  252  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000212078  normal  0.51797 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  36.98 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  38.69 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  39.12 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0110  uroporphyrinogen decarboxylase  38.31 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3674  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3867  uroporphyrinogen decarboxylase  38.92 
 
 		 357 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5118  uroporphyrinogen decarboxylase  37.91 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  36.95 
 
 		 351 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  37.43 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1403  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.227332 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0705  uroporphyrinogen decarboxylase  38.51 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2264  uroporphyrinogen decarboxylase  39.09 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157511  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  38.51 
 
 		 356 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3304  uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 364 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  38.32 
 
 		 354 aa  248  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  37.31 
 
 		 355 aa  248  9e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4080  uroporphyrinogen decarboxylase  37.57 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1580  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3022  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  38.32 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3349  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0101  uroporphyrinogen decarboxylase  38.03 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  37.43 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0032  uroporphyrinogen decarboxylase  37.09 
 
 		 355 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.590696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3963  uroporphyrinogen decarboxylase  38.81 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0111  uroporphyrinogen decarboxylase  39.1 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0979299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  38.1 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  38.32 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>