83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0864 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  867    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  54.95 
 
 		 448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  42.91 
 
 		 531 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  44.19 
 
 		 457 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 510 aa  362  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  42.09 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  39.7 
 
 		 498 aa  323  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  42.76 
 
 		 458 aa  323  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  37.98 
 
 		 509 aa  319  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  38.43 
 
 		 493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  43.85 
 
 		 443 aa  308  9e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 457 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  40.96 
 
 		 428 aa  294  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  58.74 
 
 		 505 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  55.37 
 
 		 507 aa  275  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  58.82 
 
 		 551 aa  263  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  57.89 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  55.95 
 
 		 519 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  55.86 
 
 		 524 aa  256  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  58.6 
 
 		 530 aa  255  9e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 551 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 551 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  51.15 
 
 		 551 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  51.15 
 
 		 551 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2458  transporter, putative  57.87 
 
 		 529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  57.6 
 
 		 531 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  57.67 
 
 		 531 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  48.71 
 
 		 518 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  54.35 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  56.7 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  32.88 
 
 		 450 aa  227  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  32.89 
 
 		 450 aa  227  4e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1021  major facilitator superfamily MFS_1  56.88 
 
 		 495 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 457 aa  218  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1614  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000115723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0898  major facilitator superfamily permease  28.22 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  31.67 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0041  major facilitator superfamily permease  29.13 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000141077  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0832  major facilitator superfamily permease  32.18 
 
 		 453 aa  199  7e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000561592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0596  major facilitator transporter  52.8 
 
 		 500 aa  193  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0084  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 461 aa  176  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380135  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  29.04 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02289  sucrose transporter, putative (Eurofung)  21.63 
 
 		 635 aa  74.3  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01690  conserved hypothetical protein  21.52 
 
 		 674 aa  60.1  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.887535  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  28.65 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  22.2 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0339  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  33.33 
 
 		 479 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02982  sucrose transporter, putative (Eurofung)  21.97 
 
 		 516 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.11 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.31 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 461 aa  48.5  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 421 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  21.15 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  23.8 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.24 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  28 
 
 		 469 aa  43.5  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.27 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  52.38 
 
 		 467 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  27.52 
 
 		 445 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1231  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 397 aa  43.1  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>