More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_86070 on replicon NC_009355
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009355  OSTLU_86070  predicted protein  100 
 
 
608 aa  1262    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13664  predicted protein  42.67 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00050  tRNA dihydrouridine synthase, putative  38.67 
 
 
725 aa  411  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_1214  predicted protein  53.74 
 
 
361 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83606  dihydrouridine synthase of tRNA  36.26 
 
 
613 aa  361  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.85826  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00818  tRNA-dihydrouridine synthase 3 (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BF62]  35.76 
 
 
714 aa  330  4e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4121  predicted protein  33.91 
 
 
287 aa  173  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.381062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2343  TIM-barrel protein, nifR3 family  35.17 
 
 
328 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0025  NifR3 family protein  32.48 
 
 
320 aa  154  5e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2685  nifR3 family TIM-barrel protein  32.75 
 
 
322 aa  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000366446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2783  putative dihydrouridine synthase  29.89 
 
 
326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2469  putative dihydrouridine synthase  29.89 
 
 
326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0247  tRNA-dihydrouridine synthase B  30.71 
 
 
306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3790  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  35.62 
 
 
352 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0937  phosphoribosylamine--glycine ligase  31.32 
 
 
307 aa  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2083  TIM-barrel protein, nifR3 family  32.5 
 
 
328 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10310  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  36.12 
 
 
341 aa  145  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.193475  unclonable  0.00000000180311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0074  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.77 
 
 
333 aa  144  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1169  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  30.47 
 
 
318 aa  143  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0425  NifR3 family TIM-barrel protein  34.32 
 
 
324 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0176336  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0158  tRNA-dihydrouridine synthase B  32.62 
 
 
305 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.116258  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1650  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.91 
 
 
330 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  0.0220296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4974  TIM-barrel protein, nifR3 family  32.01 
 
 
398 aa  141  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1005  dihydrouridine synthase family protein  33.47 
 
 
325 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.667167  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl029  tRNA dihydrouridine synthetase  32.63 
 
 
325 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0112  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.28 
 
 
327 aa  141  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.518902  hitchhiker  0.000116577 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2184  TIM-barrel protein, nifR3 family  29.18 
 
 
346 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.067096  normal  0.397805 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0661  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.67 
 
 
354 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.618567 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2942  TIM-barrel protein, nifR3 family  29.45 
 
 
320 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0210  tRNA-dihydrouridine synthase B  30.14 
 
 
308 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0373  putative tRNA-dihydrouridine synthase  28.32 
 
 
331 aa  139  1e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1277  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.34 
 
 
332 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360448  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1752  dihydrouridine synthase (Dus) superfamily protein  30.25 
 
 
307 aa  139  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0711184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1403  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.77 
 
 
321 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000126451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2807  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.33 
 
 
321 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0242  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.74 
 
 
348 aa  139  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0191961  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1926  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.27 
 
 
351 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0994429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0914  nifR3 family TIM-barrel protein  33.33 
 
 
347 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0245  nifR3 family TIM-barrel protein  29.43 
 
 
333 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0136  tRNA-dihydrouridine synthase B  32.27 
 
 
308 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03937  tRNA-dihydrouridine synthase B  29.47 
 
 
332 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3077  nifR3 family TIM-barrel protein  32.09 
 
 
329 aa  138  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2561  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  33.48 
 
 
324 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000534823 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3847  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.76 
 
 
348 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0118  tRNA-dihydrouridine synthase B  31.91 
 
 
308 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3933  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.91 
 
 
348 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0021  NifR3 family TIM-barrel protein  31.41 
 
 
333 aa  136  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1528  dihydrouridine synthase DuS  29.03 
 
 
301 aa  136  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000383307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00690  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  32.03 
 
 
333 aa  136  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5233  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  32.76 
 
 
332 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.471264  hitchhiker  0.000000472201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2996  TIM-barrel protein, nifR3 family  28.33 
 
 
329 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0479  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.06 
 
 
327 aa  136  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0020045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0083  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  33.19 
 
 
332 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.419375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  32.76 
 
 
332 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0074  NifR3 family TIM-barrel protein  32.76 
 
 
332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0071  NifR3 family TIM-barrel protein  32.76 
 
 
332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0071  NifR3 family TIM-barrel protein  32.76 
 
 
332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0403  TIM-barrel protein, nifR3 family  34.45 
 
 
358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000189855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0087  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  32.76 
 
 
332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.811614  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0084  putative TIM-barrel protein, NifR3 family  32.76 
 
 
332 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000319456 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0273  nifR3 family TIM-barrel protein  29.27 
 
 
347 aa  135  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2560  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.65 
 
 
352 aa  135  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0091  dihydrouridine synthase DuS  32.77 
 
 
305 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0071  nifR3 family TIM-barrel protein  32.76 
 
 
332 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0154  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.47 
 
 
351 aa  134  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.386223  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2132  TIM-barrel protein, nifR3 family  31.78 
 
 
347 aa  133  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0864  nifR3 family TIM-barrel protein  32.2 
 
 
349 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0172  nifR3 family TIM-barrel protein  30.21 
 
 
319 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000224205  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3365  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  30.03 
 
 
388 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815066  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1074  nifR3 family TIM-barrel protein  32.05 
 
 
332 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0276  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.91 
 
 
354 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6205  hypothetical protein  28.32 
 
 
373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545793  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0075  NifR3 family TIM-barrel protein  32.31 
 
 
324 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0075  NifR3 family TIM-barrel protein  32.31 
 
 
324 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2456  dihydrouridine synthase  32.77 
 
 
350 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0231  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 
325 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1825  NifR3/Smm1 family protein  30.25 
 
 
325 aa  130  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3665  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.65 
 
 
337 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3909  nifR3 family TIM-barrel protein  35.19 
 
 
348 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329543  normal  0.406839 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0758  putative tRNA-dihydrouridine synthase  30.11 
 
 
317 aa  130  9.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.164456  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2691  NifR3 family TIM-barrel protein  29.58 
 
 
354 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0506  NIFR3-like protein  32.07 
 
 
356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.973131  normal  0.138015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0489  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.65 
 
 
356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636322  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0645  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  32.93 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.446085  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0360  NifR3 family TIM-barrel protein  29.11 
 
 
329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0279  tRNA-dihydrouridine synthase  30.08 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.690235  hitchhiker  0.007193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1445  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.48 
 
 
346 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6005  TIM-barrel protein, nifR3 family  33.61 
 
 
348 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2588  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein NifR3  30.99 
 
 
353 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.225137  hitchhiker  0.00524476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0429  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.51 
 
 
381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244047  normal  0.096876 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1950  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.42 
 
 
347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2288  nifR3 family TIM-barrel protein  32.35 
 
 
347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0565  tRNA-dihydrouridine synthase B  32.07 
 
 
327 aa  128  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000409979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2788  TIM-barrel protein, nifR3 family  30.8 
 
 
325 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00335838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2060  TIM-barrel protein, nifR3 family  32.17 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0270  nifR3 family TIM-barrel protein  30.42 
 
 
333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0169584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0018  TIM-barrel protein, nifR3 family  32.76 
 
 
335 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.380372  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16990  putative TIM-barrel protein, nifR3 family  27.33 
 
 
415 aa  127  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.56447  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1078  dihydrouridine synthase TIM-barrel protein nifR3  31.93 
 
 
343 aa  127  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.165746  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2221  tRNA-dihydrouridine synthase  31.33 
 
 
334 aa  127  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>