249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31894 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_31894  predicted protein  100 
 
 
1594 aa  3280    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42940  predicted protein  26.28 
 
 
1337 aa  156  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.544378  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  25.36 
 
 
972 aa  84.7  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.362577 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  30.04 
 
 
1132 aa  79.3  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  34.96 
 
 
1112 aa  77  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.34 
 
 
977 aa  75.5  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 
922 aa  73.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
982 aa  73.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  35.88 
 
 
1127 aa  73.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  34.71 
 
 
1250 aa  72  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  32.09 
 
 
1415 aa  70.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.671763 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  30.66 
 
 
1130 aa  70.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  32.37 
 
 
1127 aa  70.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  32 
 
 
1129 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  32.45 
 
 
1170 aa  70.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82348  DNA-dependent ATPase of the nucleotide excision repair factor 4 complex  23.58 
 
 
1343 aa  70.5  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.968646  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  32.52 
 
 
1184 aa  68.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  37.6 
 
 
674 aa  68.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  29.45 
 
 
1086 aa  67.8  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  28.57 
 
 
1003 aa  67.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
1261 aa  67.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  29.45 
 
 
806 aa  67  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  36.15 
 
 
872 aa  66.6  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 
1068 aa  66.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
1120 aa  65.9  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  31.21 
 
 
900 aa  65.9  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  30.41 
 
 
1068 aa  65.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  25.51 
 
 
1198 aa  64.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  26.83 
 
 
1277 aa  65.1  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
950 aa  64.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  46.25 
 
 
1761 aa  64.7  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  26.32 
 
 
1443 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.82 
 
 
1143 aa  64.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  30.56 
 
 
701 aa  64.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  31.71 
 
 
985 aa  63.9  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 
1091 aa  63.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  29.41 
 
 
959 aa  63.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  30.16 
 
 
964 aa  63.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  31.41 
 
 
1394 aa  62.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.5 
 
 
1110 aa  62.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  31.45 
 
 
842 aa  62.4  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  28.04 
 
 
1209 aa  62.4  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  30.71 
 
 
1120 aa  62.4  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  30.71 
 
 
1120 aa  62.4  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 
1171 aa  62  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  30.95 
 
 
1086 aa  61.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.29 
 
 
1118 aa  61.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  29.05 
 
 
1068 aa  61.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  31.68 
 
 
707 aa  60.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  27.4 
 
 
1154 aa  60.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46863  predicted protein  30.37 
 
 
1597 aa  59.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
1066 aa  58.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  28.97 
 
 
1381 aa  58.9  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  28.46 
 
 
1164 aa  58.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  24.33 
 
 
1432 aa  58.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  29.6 
 
 
1163 aa  58.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45116  predicted protein  35.65 
 
 
1843 aa  58.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116099  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
1089 aa  58.2  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  33.61 
 
 
1086 aa  58.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  30.89 
 
 
1848 aa  57.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  27.13 
 
 
1142 aa  57.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  28.68 
 
 
1096 aa  57.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 
1068 aa  57.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  32.06 
 
 
715 aa  57  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  27.73 
 
 
727 aa  57  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
1160 aa  57  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  31.4 
 
 
1071 aa  57  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  29.71 
 
 
1045 aa  56.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
1069 aa  56.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  32.5 
 
 
746 aa  55.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
1055 aa  55.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 
1021 aa  55.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  31.61 
 
 
868 aa  55.5  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6693  SNF2-related protein  31.03 
 
 
1121 aa  55.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01961  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10830)  24.2 
 
 
1502 aa  54.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.288064  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  44.12 
 
 
1202 aa  55.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
1164 aa  55.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  30.23 
 
 
1359 aa  55.1  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  29.41 
 
 
939 aa  54.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  25.29 
 
 
947 aa  55.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 
966 aa  54.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1035  helicase domain-containing protein  30.16 
 
 
291 aa  55.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.58 
 
 
1082 aa  54.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 
1090 aa  54.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01470  hypothetical protein  26.76 
 
 
1586 aa  54.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  32 
 
 
1131 aa  54.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  37.97 
 
 
1019 aa  54.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
1110 aa  54.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  28.86 
 
 
1150 aa  53.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  33.72 
 
 
1081 aa  53.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  29.84 
 
 
1357 aa  53.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  31.15 
 
 
1073 aa  53.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  28.7 
 
 
1202 aa  53.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 
1155 aa  53.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 
1113 aa  53.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  28.8 
 
 
1113 aa  53.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  32.14 
 
 
1222 aa  53.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  27.61 
 
 
1769 aa  52.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  27.97 
 
 
1159 aa  52.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  29.75 
 
 
1161 aa  52.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>