126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2656 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  100 
 
 		 1288 aa  2605    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1284 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1309 aa  336  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  25.82 
 
 		 1304 aa  333  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  26 
 
 		 1307 aa  309  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1264 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1261 aa  289  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1265 aa  288  4e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1283 aa  285  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1341 aa  283  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  25.89 
 
 		 1300 aa  280  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1267 aa  278  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1273 aa  271  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1273 aa  267  8.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1276 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1269 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1271 aa  263  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1277 aa  261  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1271 aa  254  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1274 aa  254  8.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1275 aa  252  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1286 aa  248  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1271 aa  244  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1381 aa  244  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1273 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.02 
 
 		 1346 aa  237  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1271 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1291 aa  235  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1276 aa  231  9e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  21.19 
 
 		 1301 aa  225  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.53 
 
 		 1273 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1384 aa  224  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1277 aa  220  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1276 aa  219  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1306 aa  219  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1284 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1419 aa  218  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1383 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  26.31 
 
 		 1426 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1425 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1307 aa  216  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1305 aa  216  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1379 aa  215  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1141 aa  215  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  21.61 
 
 		 1307 aa  214  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  21.29 
 
 		 1287 aa  214  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1443 aa  212  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  24.5 
 
 		 1426 aa  206  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  21.63 
 
 		 1439 aa  206  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  21.99 
 
 		 1266 aa  204  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1390 aa  204  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1266 aa  204  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1436 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1266 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1266 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1266 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1426 aa  202  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  22 
 
 		 1266 aa  202  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  19.45 
 
 		 1294 aa  202  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22 
 
 		 1266 aa  201  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1266 aa  202  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22 
 
 		 1266 aa  201  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1266 aa  201  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  20.76 
 
 		 1441 aa  201  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1266 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  21.64 
 
 		 1266 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1266 aa  198  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1266 aa  198  5.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  21.03 
 
 		 1380 aa  197  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  23.33 
 
 		 1224 aa  197  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  20.25 
 
 		 1416 aa  196  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1392 aa  195  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  21.46 
 
 		 1331 aa  194  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1398 aa  193  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  20.94 
 
 		 1265 aa  194  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1441 aa  191  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.13 
 
 		 1417 aa  191  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1446 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1399 aa  189  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1399 aa  189  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  20.55 
 
 		 1266 aa  189  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1398 aa  189  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1398 aa  188  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1454 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1210 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1459 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  25 
 
 		 1399 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1378 aa  184  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  20.18 
 
 		 1417 aa  183  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1419 aa  183  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1394 aa  182  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1399 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  21.42 
 
 		 1291 aa  181  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1290 aa  178  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  22.64 
 
 		 1384 aa  177  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  20.24 
 
 		 1301 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1420 aa  174  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1399 aa  173  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  22.21 
 
 		 1379 aa  172  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1428 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>