217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2215 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2215  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  772    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1458  hypothetical protein  58.85 
 
 		 385 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1163  ABC transporter, permease protein  55.73 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.258105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2406  hypothetical protein  56.77 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0109009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  57.29 
 
 		 385 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3262  protein of unknown function DUF214  53.65 
 
 		 385 aa  425  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0989  protein of unknown function DUF214  53.39 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1793  hypothetical protein  56.51 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.093544  normal  0.804563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0629  protein of unknown function DUF214  54.05 
 
 		 383 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0678619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0229  hypothetical protein  54.95 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  hitchhiker  0.000000332734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3401  ABC efflux pump, inner membrane subunit  54.69 
 
 		 384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2522  hypothetical protein  52.48 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5858  hypothetical protein  57.03 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0221  hypothetical protein  54.17 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2804  hypothetical protein  53.65 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.567151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0302  hypothetical protein  53.65 
 
 		 384 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0283  hypothetical protein  53.65 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568273  hitchhiker  0.0000204424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0205  hypothetical protein  53.91 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786669  unclonable  0.00000000000952284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3710  hypothetical protein  57.47 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.76 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2022  hypothetical protein  34.93 
 
 		 388 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0252  protein of unknown function DUF214  35.75 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.206275  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1513  hypothetical protein  37.7 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  35.53 
 
 		 387 aa  202  9e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03341  ABC transporter permease  33.23 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0818  hypothetical protein  34.5 
 
 		 385 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  30.92 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  31.52 
 
 		 379 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  25.18 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.19 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.65 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3165  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.296163  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  26.45 
 
 		 876 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.21 
 
 		 836 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2967  hypothetical protein  25.62 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  24.76 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  22.26 
 
 		 868 aa  58.5  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  31.01 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  34.27 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 848 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  23.75 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.37 
 
 		 850 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.46 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  25.46 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  25.46 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  26.53 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  31.11 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  23.89 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  27.13 
 
 		 380 aa  53.5  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  27.54 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  26.94 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  24.9 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  24.28 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  23.89 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  22.9 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  27.27 
 
 		 422 aa  53.1  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  27.18 
 
 		 807 aa  52.8  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  24.18 
 
 		 429 aa  52.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  23.21 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  23.55 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 		 806 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  23.86 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.84 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  26.81 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  24.04 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.98 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  26.87 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.48 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0218  protein of unknown function DUF214  22.81 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181881 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  22.4 
 
 		 859 aa  51.6  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  21.93 
 
 		 1016 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1213  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1449  hypothetical protein  33.94 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  22.82 
 
 		 863 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  25.19 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  25.88 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  31.53 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  38.18 
 
 		 871 aa  50.4  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.63 
 
 		 855 aa  50.4  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  25.93 
 
 		 417 aa  50.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  36.45 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  27.59 
 
 		 431 aa  50.1  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.41 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  21.81 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  28.28 
 
 		 467 aa  49.7  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 436 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  21.2 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  23.34 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  25.98 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 		 853 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  25.86 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  21.39 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  22.3 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  23.01 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  25.49 
 
 		 798 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1442  protein of unknown function DUF214  35.96 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00639135  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>