More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0166 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
454 aa  891    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  57.28 
 
 
1328 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.15 
 
 
787 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.68 
 
 
771 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  53.66 
 
 
1215 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.79 
 
 
1424 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  52.08 
 
 
924 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  57.46 
 
 
911 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  52.12 
 
 
991 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  47.15 
 
 
1039 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.85 
 
 
885 aa  388  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.74 
 
 
767 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  44.83 
 
 
1105 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  58.08 
 
 
444 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  47.16 
 
 
1507 aa  362  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  44.42 
 
 
1288 aa  362  6e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  46.91 
 
 
725 aa  358  9e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.07 
 
 
568 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  49.07 
 
 
568 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.08 
 
 
1186 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  59.39 
 
 
751 aa  343  5e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  51.44 
 
 
843 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  38.98 
 
 
1050 aa  335  7.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  48.5 
 
 
825 aa  325  9e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  37.25 
 
 
1262 aa  322  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  44.2 
 
 
1044 aa  317  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  45.82 
 
 
1131 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  52.25 
 
 
362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  53.26 
 
 
919 aa  300  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  54.94 
 
 
284 aa  296  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  36.84 
 
 
1488 aa  296  7e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  43.72 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  39.76 
 
 
799 aa  277  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  43.75 
 
 
493 aa  276  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  50.75 
 
 
672 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  38.38 
 
 
822 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  35.81 
 
 
1128 aa  270  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
953 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
1185 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  53.44 
 
 
311 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  38.82 
 
 
732 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  43.49 
 
 
814 aa  252  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  34.72 
 
 
1040 aa  249  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  32.28 
 
 
2145 aa  248  1e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  49.47 
 
 
680 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  30.15 
 
 
1550 aa  243  6e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  36.17 
 
 
1125 aa  242  7.999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  35.16 
 
 
828 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  42.86 
 
 
977 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  59.41 
 
 
212 aa  234  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  55.51 
 
 
785 aa  231  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  48.56 
 
 
481 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  36.36 
 
 
1056 aa  226  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.19 
 
 
667 aa  225  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  40.8 
 
 
669 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 
1290 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
1028 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  32.94 
 
 
919 aa  213  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  33.42 
 
 
694 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 
949 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  38.75 
 
 
776 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  34.91 
 
 
1313 aa  206  9e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  40.06 
 
 
963 aa  203  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  29.98 
 
 
740 aa  199  9e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  32.49 
 
 
1068 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 
1088 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
837 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  52.41 
 
 
190 aa  193  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
1283 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.7 
 
 
1404 aa  189  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 
469 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  32.2 
 
 
1238 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  31.54 
 
 
1475 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 
857 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  30.87 
 
 
708 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
966 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.42 
 
 
968 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  29.71 
 
 
1106 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
649 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  39.14 
 
 
1596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
1054 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  32.53 
 
 
782 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
304 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  32.81 
 
 
1136 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 
1146 aa  156  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  27.7 
 
 
836 aa  154  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  39.13 
 
 
801 aa  153  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  31.31 
 
 
686 aa  152  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  39.3 
 
 
1101 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 
577 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  31.54 
 
 
1324 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
937 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  30.65 
 
 
2327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
1060 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  30.65 
 
 
1212 aa  145  1e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 
1435 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.65 
 
 
854 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  32.25 
 
 
713 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  32.37 
 
 
1228 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 
991 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>