More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3718 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  100 
 
 
278 aa  565  1e-160  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  81.95 
 
 
281 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  72.56 
 
 
279 aa  419  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  70.04 
 
 
281 aa  378  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  69.45 
 
 
295 aa  363  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  30.13 
 
 
293 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
275 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  26.1 
 
 
296 aa  86.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  28.38 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  33.49 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  27.93 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.49 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.75 
 
 
300 aa  72  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  30.37 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  27.23 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  27.23 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  28.12 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  31.21 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  30 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.23 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.46 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.84 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  36.23 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  31.84 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
140 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  26.64 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  27.73 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  31.16 
 
 
139 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  29.01 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  30.71 
 
 
140 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  29.72 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  26.48 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  30 
 
 
140 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  30.87 
 
 
153 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  29.29 
 
 
140 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
157 aa  62  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  28.63 
 
 
297 aa  62.4  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.81 
 
 
128 aa  62.4  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  29.29 
 
 
140 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
143 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  31.54 
 
 
151 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  24.41 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  27.98 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  31.43 
 
 
141 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  24.59 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  27.99 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
412 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.378287  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  34.31 
 
 
138 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  25.08 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 
162 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 
306 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  29.29 
 
 
140 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  29.29 
 
 
140 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  29.29 
 
 
140 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  29.29 
 
 
140 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  29.29 
 
 
140 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  23.75 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1011  UspA domain protein  23.79 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000787918 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  26.83 
 
 
298 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  26.37 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  29.39 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.25 
 
 
283 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0255  UspA domain protein  26.47 
 
 
291 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955091  normal  0.331109 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  29.05 
 
 
273 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.86 
 
 
141 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  25.42 
 
 
303 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2182  UspA domain protein  21.92 
 
 
292 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  23.87 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.64 
 
 
148 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2244  UspA domain protein  21.92 
 
 
292 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.616395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
128 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  27.56 
 
 
280 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 
147 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.94 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 
291 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  33.57 
 
 
162 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  29.65 
 
 
311 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  33.57 
 
 
162 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  27.35 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  36.36 
 
 
143 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  30.99 
 
 
147 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  31.43 
 
 
294 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0161  UspA domain-containing protein  23.65 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  26.32 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  25.68 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  29.69 
 
 
288 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
144 aa  53.9  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  25 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  27.03 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
277 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
138 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  31.11 
 
 
137 aa  53.1  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  35.14 
 
 
151 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>