76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3655 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  100 
 
 
236 aa  471  1e-132  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0497  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.02 
 
 
243 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4053  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.45 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1307  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.33 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1151  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.69 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.515293  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  25.36 
 
 
994 aa  58.9  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0458  bacterio-opsin activator  46.43 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.484707  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2525  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.53 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.711382 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 
677 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4109  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.89 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1425  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.69 
 
 
194 aa  55.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  28.87 
 
 
1589 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3037  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.29 
 
 
217 aa  52.4  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.43 
 
 
269 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  42.11 
 
 
781 aa  52.4  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  37.68 
 
 
737 aa  52  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  35.06 
 
 
644 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.22 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1916  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.28 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2183  bacterio-opsin activator  31.3 
 
 
192 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.287047  hitchhiker  0.000258487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  37.1 
 
 
807 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  31.43 
 
 
524 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1983  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.94 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
1969 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3545  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.97 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.773914  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1621  bacterio-opsin activator  37.93 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1720  bacterio-opsin activator  28.67 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  27.78 
 
 
770 aa  48.9  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  32.95 
 
 
843 aa  48.9  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  39.29 
 
 
919 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.98 
 
 
251 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.15 
 
 
212 aa  48.5  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3294  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  24.32 
 
 
216 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1762  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  37.29 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.91 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.41 
 
 
228 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.93 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2914  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.52 
 
 
219 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2889  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.6 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5124  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.29 
 
 
211 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4634  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40 
 
 
225 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 
1073 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0874  bacterio-opsin activator  24.22 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  37.68 
 
 
532 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.05 
 
 
598 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3736  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.81 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.26 
 
 
564 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3051  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.86 
 
 
218 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.26 
 
 
637 aa  45.1  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1028  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.09 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196411  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0553  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.95 
 
 
198 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 
1260 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3833  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.66 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0543  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  25.95 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0823  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  21.77 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1221  bacterio-opsin activator  23.39 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  38.46 
 
 
712 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  36.92 
 
 
449 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0992  bacterio-opsin activator  26.67 
 
 
178 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000881658  hitchhiker  0.00988265 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  34.33 
 
 
1081 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1818  bacterio-opsin activator  44.44 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.871234  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.37 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2345  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.21 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1336  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.3 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292593  normal  0.783067 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4165  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.36 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2387  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  22.48 
 
 
229 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4044  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.86 
 
 
214 aa  42.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0915  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  39.13 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1609  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  36.76 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.680269  normal  0.358173 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1655  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  38.3 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  33.9 
 
 
750 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0921  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  35.71 
 
 
248 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0803  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  44.07 
 
 
220 aa  42  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  26.23 
 
 
1216 aa  42  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
1071 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
1059 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>