More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0067 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0067  UspA domain protein  100 
 
 
126 aa  248  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0416151  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  43.44 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  41.8 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  39.68 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  38.84 
 
 
207 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  36.8 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  38.58 
 
 
307 aa  71.6  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  36.64 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  37.69 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  35.48 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.1 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  34.96 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  37.19 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.5 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.67 
 
 
300 aa  68.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  39.67 
 
 
286 aa  67.8  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  35.92 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  38.89 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  34.38 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.91 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  37.9 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  34.71 
 
 
281 aa  63.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  33.61 
 
 
415 aa  63.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  37.19 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  42.24 
 
 
118 aa  62.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  33.07 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  37.7 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  31.75 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  31.09 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  36.67 
 
 
136 aa  60.1  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.69 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35.48 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  36.13 
 
 
283 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  36.8 
 
 
301 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  40.16 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  36.15 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  34.38 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.75 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  30.53 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  33.33 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.06 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.31 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  29.51 
 
 
295 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  32 
 
 
167 aa  56.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  29.37 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  35.94 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  29.55 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  34.48 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  30.95 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  33.87 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.15 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  27.64 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  32.48 
 
 
146 aa  53.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.73 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  31.03 
 
 
145 aa  53.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  34.07 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  43.55 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  29.37 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  31.62 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.4 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  31.71 
 
 
158 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  33.88 
 
 
304 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  27.05 
 
 
128 aa  52.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  32.54 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  32.31 
 
 
291 aa  52  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  29.51 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  25.2 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  30.4 
 
 
305 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  29.03 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  34.48 
 
 
143 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  30.77 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  26.45 
 
 
145 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  44.44 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0018  UspA domain protein  32.99 
 
 
162 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  24.41 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  30.22 
 
 
200 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  37.5 
 
 
141 aa  50.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  26.56 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  28.03 
 
 
157 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  43.28 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.35 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  34.23 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.89 
 
 
283 aa  50.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.02 
 
 
164 aa  50.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  23.88 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  33.33 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  30.08 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  27.27 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  35.71 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  30.58 
 
 
294 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  33.85 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  30.83 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.89 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  32.04 
 
 
167 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>