120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2833 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2833  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 344 aa  678    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.922484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1902  hypothetical protein  45.89 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  37.31 
 
 		 963 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  37.74 
 
 		 1056 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  34.08 
 
 		 801 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1039 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  30.83 
 
 		 1050 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  31.6 
 
 		 1262 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  22.76 
 
 		 1040 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 		 1186 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  31.73 
 
 		 1328 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 949 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1105 aa  83.2  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  33.82 
 
 		 1128 aa  82.8  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 		 568 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 568 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1215 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  34.55 
 
 		 713 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 1288 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 837 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  28.46 
 
 		 1488 aa  77.4  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 1185 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  37.07 
 
 		 702 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  26.77 
 
 		 1131 aa  73.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  27.38 
 
 		 825 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 814 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 767 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.83 
 
 		 991 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 924 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  40.62 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 		 919 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  35.75 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  28.74 
 
 		 725 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 843 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  24 
 
 		 828 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 		 787 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  30.43 
 
 		 1468 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 		 1125 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6223  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.3 
 
 		 994 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  26.4 
 
 		 822 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  28 
 
 		 680 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  27.6 
 
 		 672 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.55 
 
 		 771 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.11 
 
 		 740 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.03 
 
 		 1424 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.58 
 
 		 1228 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  29.28 
 
 		 1475 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1550 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 605 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  32.31 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.29 
 
 		 1507 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  30.92 
 
 		 1311 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  28.12 
 
 		 1146 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  39 
 
 		 934 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1068 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  28.24 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 481 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  29.53 
 
 		 958 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.93 
 
 		 732 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 		 1290 aa  54.7  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.8 
 
 		 885 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  31.72 
 
 		 899 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6335  hypothetical protein  41.18 
 
 		 144 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  29.36 
 
 		 953 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4122  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.33 
 
 		 1126 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289873  decreased coverage  0.00939921 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.89 
 
 		 2145 aa  53.9  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21130  hypothetical protein  32.05 
 
 		 199 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.368584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  29.34 
 
 		 849 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  27.46 
 
 		 1136 aa  53.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 751 aa  52.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1088 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  24.06 
 
 		 686 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  31.09 
 
 		 847 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  40.59 
 
 		 675 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  45.12 
 
 		 640 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  27.64 
 
 		 493 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  34.23 
 
 		 829 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11710  hypothetical protein  35.58 
 
 		 298 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.898295  normal  0.617645 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20 
 
 		 1404 aa  49.7  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 857 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00971  ORF Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79028]  36.25 
 
 		 124 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.298424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 1028 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  28.39 
 
 		 1324 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  24.64 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  26.74 
 
 		 799 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1684  hypothetical protein  32.5 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 911 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  28.51 
 
 		 845 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 1737 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47294  predicted protein  24.62 
 
 		 777 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  29.55 
 
 		 528 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 190 aa  47  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.71 
 
 		 1036 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 776 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33193  predicted protein  33.33 
 
 		 885 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.627765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 966 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>