More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3217 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  36.27 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0380  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  38.81 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 235 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  31.93 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 250 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  30.89 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  35.14 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11846  transcriptional regulator  26.72 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.360584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  25.93 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  21.79 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 259 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  31.13 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  22.06 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  32.18 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.78 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  28.3 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  36.14 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>