More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2762 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2762  type II secretion system protein E  100 
 
 		 452 aa  900    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0831421  hitchhiker  0.00208523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4142  type II secretion system protein E  52.05 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.965239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1306  secretion ATPase protein  51.04 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.074017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8203  type II secretion system protein E  49.89 
 
 		 442 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3134  type II secretion system protein E  50.12 
 
 		 448 aa  349  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0451896  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1541  type II secretion system protein E  47.48 
 
 		 437 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4729  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8599  type II secretion system protein E  45.24 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126695  normal  0.494371 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4644  type II secretion system protein E  38.78 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4031  type II secretion system protein E  39.39 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148527  hitchhiker  0.00766622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 456 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2594  type II secretion system protein E  44.38 
 
 		 483 aa  234  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0671  type II secretion system protein E  42.6 
 
 		 471 aa  233  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1223  type II secretion system protein E  43.65 
 
 		 452 aa  230  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1736  type II secretion system protein E  42.89 
 
 		 481 aa  216  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00343122  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  39.09 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4970  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 504 aa  190  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297682  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  38.74 
 
 		 463 aa  190  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  38.74 
 
 		 463 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  38.99 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4457  type II secretion system protein E  36 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  37.54 
 
 		 449 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  35.95 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0842  type II secretion system protein E  38.02 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0127563  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  35.43 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  35.43 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  37.35 
 
 		 487 aa  183  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3419  type II secretion system protein E  34.41 
 
 		 523 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  37.13 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  36.39 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  37.13 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  36.13 
 
 		 446 aa  181  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  36.78 
 
 		 438 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  32.37 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  36.55 
 
 		 450 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  36.42 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  36.84 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  36.42 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  36.55 
 
 		 450 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  36.55 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  36.55 
 
 		 450 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  40 
 
 		 478 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  36.42 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  36.89 
 
 		 412 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  38.12 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  34.3 
 
 		 479 aa  178  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  37.07 
 
 		 469 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  36.99 
 
 		 639 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  37.3 
 
 		 589 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  36.23 
 
 		 472 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  36.78 
 
 		 469 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  36.34 
 
 		 411 aa  176  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  35.6 
 
 		 478 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  33.42 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  36.96 
 
 		 572 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  34.07 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  33.69 
 
 		 474 aa  173  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  33.42 
 
 		 417 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  32.08 
 
 		 473 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  36.18 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  33.96 
 
 		 513 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  38.24 
 
 		 485 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  34.26 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  32.13 
 
 		 594 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  32.07 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  37.27 
 
 		 569 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  35.84 
 
 		 438 aa  170  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  34.51 
 
 		 454 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  34.33 
 
 		 450 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  35.33 
 
 		 677 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  37.69 
 
 		 563 aa  169  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  32.71 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  34.37 
 
 		 455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  36.68 
 
 		 482 aa  166  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  32.88 
 
 		 455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  32.88 
 
 		 455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  34.67 
 
 		 455 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  35.65 
 
 		 452 aa  166  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  35.42 
 
 		 483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  34.47 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  33.03 
 
 		 472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 504 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  37.13 
 
 		 488 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  34.39 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  37.86 
 
 		 500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  33.99 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  37.27 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2222  type II secretion system protein E  33.19 
 
 		 559 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  33.43 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  35.42 
 
 		 508 aa  164  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  37.25 
 
 		 491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 480 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  34.8 
 
 		 482 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  36.05 
 
 		 490 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  36.05 
 
 		 489 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  37.25 
 
 		 491 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  35.35 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  33.99 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>