More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4913 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  298  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  64.23 
 
 
142 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  64.23 
 
 
142 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  64.23 
 
 
142 aa  174  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 
172 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
173 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  33.03 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  33.03 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  33.99 
 
 
159 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  30 
 
 
206 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
193 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  35.9 
 
 
157 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 
143 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
170 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
208 aa  53.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  24.16 
 
 
157 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 
171 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  33.1 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  30.53 
 
 
178 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
162 aa  50.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
189 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
315 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  23.36 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  26.92 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  28.91 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  29.5 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0215  transcriptional regulator, TrmB  30.17 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  31.03 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
168 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
139 aa  48.5  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>