122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2941 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2941  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  100 
 
 
265 aa  530  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.608809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  37.86 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.85 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  33.33 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.73 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  29.21 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.61 
 
 
222 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  39.39 
 
 
227 aa  52.8  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
239 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  41.49 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  31.78 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  32.09 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.34 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.65 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  40.4 
 
 
256 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  32.59 
 
 
247 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  25.21 
 
 
223 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  24.45 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
234 aa  49.3  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  33.85 
 
 
219 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.36 
 
 
234 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0739  hydrolase  32.05 
 
 
230 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.715617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  32.04 
 
 
232 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  25.96 
 
 
209 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.89 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  32.04 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  27.46 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  29.37 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  29.37 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  29.37 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  29.37 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  29.37 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  41.41 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
218 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  31.45 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  25.35 
 
 
234 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  29.29 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1734  hydrolase  28.85 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  35 
 
 
217 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  34.23 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  41.41 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  41.41 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  30.39 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.91 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  23.35 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  26.92 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0554  hydrolase  32.2 
 
 
231 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  33 
 
 
218 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  25.11 
 
 
224 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  26.63 
 
 
234 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  27.14 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  23.95 
 
 
230 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  37.37 
 
 
223 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  39.8 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.12 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  40.4 
 
 
231 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.51 
 
 
220 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  24.2 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  39.13 
 
 
228 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.83 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  25.7 
 
 
224 aa  45.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  31.78 
 
 
233 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.63 
 
 
223 aa  45.8  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0750  hydrolase  29.53 
 
 
233 aa  45.4  0.0008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.57 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 
224 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  30.56 
 
 
226 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  27.44 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  26.43 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  27.6 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25 
 
 
224 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  30.25 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92236  predicted protein  23.18 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000528701  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  27.45 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  30.4 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.57 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  24.09 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  38.78 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  39.39 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  25.84 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  24.74 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  27.92 
 
 
226 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  25.89 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  33 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  27.34 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  41.38 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  25.21 
 
 
224 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
225 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  24.89 
 
 
235 aa  43.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1741  HAD superfamily hydrolase  25.18 
 
 
178 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.985447  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  28.21 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  35.9 
 
 
225 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  33 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>