More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1523 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4146  tetratricopeptide TPR_2  54.89 
 
 		 203 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631366  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2398  TPR repeat-containing protein  51.89 
 
 		 287 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 878 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.33 
 
 		 725 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 1276 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.47 
 
 		 623 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.3 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.22 
 
 		 810 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  32.19 
 
 		 1694 aa  76.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.17 
 
 		 764 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 363 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 435 aa  75.1  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  36.5 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.7 
 
 		 784 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.27 
 
 		 622 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.5 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 1252 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 4079 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  35.83 
 
 		 585 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 1252 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  30.63 
 
 		 780 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.8 
 
 		 465 aa  71.6  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 374 aa  72  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 4489 aa  71.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 543 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 681 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 927 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.37 
 
 		 1979 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.85 
 
 		 743 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  31.25 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 		 608 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 864 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  32.59 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 3145 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25 
 
 		 820 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 754 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  27.52 
 
 		 676 aa  69.7  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 		 542 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 512 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3564  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.04 
 
 		 637 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0623706  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.14 
 
 		 635 aa  68.6  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.39 
 
 		 730 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3560 aa  68.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 685 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 		 366 aa  68.6  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.04 
 
 		 638 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  27.27 
 
 		 545 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 		 632 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 562 aa  68.6  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 3035 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.89 
 
 		 561 aa  68.2  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 1737 aa  68.2  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 620 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 466 aa  68.2  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.07 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3415  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 638 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.61 
 
 		 865 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  32.18 
 
 		 795 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 465 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 754 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 467 aa  66.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  28.12 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.07 
 
 		 875 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 1061 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 502 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 614 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.89 
 
 		 1013 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.6 
 
 		 560 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.98 
 
 		 626 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 740 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 		 1034 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  32.71 
 
 		 1056 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 		 614 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  28.15 
 
 		 561 aa  65.9  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1192 aa  65.5  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 441 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.82 
 
 		 441 aa  65.5  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 750 aa  65.5  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 1069 aa  65.1  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  29.71 
 
 		 587 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  32.53 
 
 		 781 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 301 aa  65.1  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 520 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.58 
 
 		 576 aa  65.1  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1138 aa  64.7  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>