More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1816 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 		 927 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 		 543 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 602 aa  100  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 344 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.76 
 
 		 1694 aa  99.8  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 1276 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 		 562 aa  97.8  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 4079 aa  94  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  36.97 
 
 		 1979 aa  91.7  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  35.38 
 
 		 576 aa  91.3  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  33.33 
 
 		 573 aa  91.3  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 279 aa  91.3  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 523 aa  91.3  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 329 aa  90.9  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 244 aa  90.1  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  36.92 
 
 		 560 aa  89  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.81 
 
 		 784 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 366 aa  88.6  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.18 
 
 		 397 aa  88.2  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.43 
 
 		 836 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  28.99 
 
 		 240 aa  84.7  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 699 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 		 564 aa  82.4  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1138 aa  82  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  31.52 
 
 		 745 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 375 aa  81.3  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 711 aa  81.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.33 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.18 
 
 		 1007 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  34.27 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 467 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 1049 aa  79  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 955 aa  79  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1094 aa  78.6  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1192 aa  79  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.99 
 
 		 730 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 1069 aa  78.2  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 634 aa  77.8  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 635 aa  77.8  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3449  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 357 aa  77.8  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 361 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 743 aa  77.4  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  35.07 
 
 		 1013 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  33.73 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 162 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 512 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 1276 aa  75.1  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 414 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  30.46 
 
 		 1067 aa  74.7  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 254 aa  74.3  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 250 aa  74.3  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 452 aa  73.9  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.88 
 
 		 632 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.32 
 
 		 707 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 761 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4410  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.204971  normal  0.0658159 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 750 aa  73.2  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.82 
 
 		 417 aa  72.4  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 716 aa  72  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 363 aa  72  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.83 
 
 		 462 aa  72  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.83 
 
 		 314 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 409 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 388 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  27.11 
 
 		 252 aa  71.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 388 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 275 aa  71.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 732 aa  70.9  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 4489 aa  70.9  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  30.15 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 3560 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 740 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  33.58 
 
 		 623 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4312  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.02 
 
 		 554 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0740  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.773618 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 409 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  25.75 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 878 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  30.25 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 605 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.23 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  31.62 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 689 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>