More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0589 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0589  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
716 aa  1433    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.625095 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2425  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.62 
 
 
698 aa  617  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0761  hypothetical protein  40.26 
 
 
710 aa  479  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.417145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.22 
 
 
711 aa  334  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  hitchhiker  0.000000452648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1160  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.24 
 
 
701 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0604  3'-5' exonuclease  34.57 
 
 
925 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1238  3'-5' exonuclease  34.57 
 
 
925 aa  329  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.2 
 
 
706 aa  318  2e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.711638  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.34 
 
 
696 aa  295  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4277  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.19 
 
 
675 aa  296  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0712  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.5 
 
 
711 aa  290  8e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7838  Lhr-like helicase  36.09 
 
 
694 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1494  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.96 
 
 
694 aa  289  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05250  Lhr-like helicase  37.93 
 
 
702 aa  263  8e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.592976  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3658  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 
722 aa  262  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.39 
 
 
741 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1523  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.51 
 
 
711 aa  253  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.723855  hitchhiker  0.0000000000000155978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4172  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.75 
 
 
716 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0175676 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1943  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.22 
 
 
933 aa  243  7e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.546728  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2227  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.19 
 
 
710 aa  240  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1556  Lhr-like helicase  32.34 
 
 
740 aa  237  7e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.6 
 
 
890 aa  236  8e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0061  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.4 
 
 
736 aa  236  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2100  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.42 
 
 
897 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2070  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.47 
 
 
708 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2957  DEAD/DEAH box helicase-like  31.7 
 
 
753 aa  230  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0630659  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0618  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.83 
 
 
927 aa  230  6e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000220197 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1503  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.35 
 
 
937 aa  229  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220995  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.72 
 
 
928 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.877561  hitchhiker  0.00000000000300252 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.89 
 
 
739 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  31.02 
 
 
736 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1693  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.11 
 
 
928 aa  225  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000881072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.28 
 
 
744 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1670  ATP-dependent RNA helicase  31.49 
 
 
955 aa  223  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0326  ATP-dependent helicase  31.46 
 
 
734 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.55 
 
 
725 aa  222  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0763366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.83 
 
 
738 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1058  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.11 
 
 
916 aa  219  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.164302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  30 
 
 
740 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1220  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.42 
 
 
696 aa  217  8e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0444234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.15 
 
 
743 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0141  DEAD/DEAH box helicase  30.42 
 
 
743 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1750  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.89 
 
 
931 aa  213  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00374519  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2425  DEAD/H associated domain protein  29.4 
 
 
939 aa  212  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0750378  normal  0.0387243 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.97 
 
 
783 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5414  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.51 
 
 
755 aa  211  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0224  ATP-dependent helicase  31.17 
 
 
723 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0685965  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0779  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.92 
 
 
932 aa  209  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.944003  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0952  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.46 
 
 
916 aa  208  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111516 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0829  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
915 aa  207  5e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.468511 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0511  hypothetical protein  29.19 
 
 
903 aa  207  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51218 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5231  DEAD/H associated domain protein  31.1 
 
 
946 aa  207  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5141  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.09 
 
 
740 aa  207  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268323  normal  0.0636547 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1251  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
909 aa  206  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.339653  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0732  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.36 
 
 
944 aa  206  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0594  DEAD/DEAH box helicase-like  33.13 
 
 
898 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198586  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2543  DEAD/DEAH box helicase  30.52 
 
 
751 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0265  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.91 
 
 
972 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1679  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.75 
 
 
903 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3388  DEAD/H associated domain protein  29.87 
 
 
954 aa  201  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.73 
 
 
926 aa  201  5e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.477622  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1879  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.04 
 
 
970 aa  200  6e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.149039  normal  0.0231063 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.71 
 
 
912 aa  200  7e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.20041  normal  0.364429 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  28.18 
 
 
943 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0189  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.64 
 
 
734 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.583958  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.01 
 
 
913 aa  197  7e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.403606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1014  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.39 
 
 
946 aa  196  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2002  DEAD/DEAH box helicase-like  30.76 
 
 
746 aa  191  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.118676  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.04 
 
 
905 aa  189  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.97 
 
 
1476 aa  187  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1372  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.14 
 
 
913 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.828132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.79 
 
 
1412 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.18 
 
 
1505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30 
 
 
1508 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.07 
 
 
1475 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  29.41 
 
 
1573 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.05 
 
 
1518 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.87 
 
 
1480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  29.87 
 
 
1515 aa  180  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  29.76 
 
 
1388 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  34.44 
 
 
1434 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.93 
 
 
1429 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.93 
 
 
1426 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.82 
 
 
1497 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  29.57 
 
 
1688 aa  177  9e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  29.61 
 
 
941 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  29.39 
 
 
1448 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.18 
 
 
1598 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  30.18 
 
 
1598 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.41 
 
 
1514 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.18 
 
 
1598 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.18 
 
 
1598 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.33 
 
 
1626 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.65 
 
 
1451 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  30.18 
 
 
1598 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.65 
 
 
1517 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.18 
 
 
1700 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  30.18 
 
 
1599 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  29.18 
 
 
888 aa  174  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  29.57 
 
 
1448 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>