More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7100 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7100  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 357 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6532  signal transduction histidine kinase  62.61 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0793858  normal  0.366363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0623  signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.528714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 366 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  40.99 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5540  sensory box histidine kinase  33.62 
 
 		 411 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6934  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0476013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  35.31 
 
 		 354 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  31.16 
 
 		 387 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3297  hypothetical protein  37.17 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.747205  normal  0.456251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 839 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 3706 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5263  hypothetical protein  32.41 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 		 603 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 815 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 1676 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 945 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 932 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  34.03 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 		 382 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 547 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 545 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 488 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 872 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  28.21 
 
 		 544 aa  103  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 941 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 752 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 381 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 767 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 739 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 215 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 674 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 551 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 1177 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  34.93 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0498  signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 1390 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4106  signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 453 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0707076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 1560 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2346  hypothetical protein  29.55 
 
 		 364 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  32.54 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  30.08 
 
 		 539 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.4 
 
 		 744 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6718  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0742813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 465 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 771 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 535 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 662 aa  96.7  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 336 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 746 aa  96.3  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 461 aa  96.3  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 913 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  27.76 
 
 		 1239 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  26.81 
 
 		 783 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 524 aa  94  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 532 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 		 991 aa  93.6  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  36.06 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  27.68 
 
 		 541 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 405 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 1246 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 709 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1654 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 1051 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  28.32 
 
 		 534 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  28.08 
 
 		 541 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 462 aa  91.3  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  28.08 
 
 		 541 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 362 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5559  hypothetical protein  32.41 
 
 		 342 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal  0.0109335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1628  Signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 431 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 572 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 358 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 		 2693 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1636  two component sensor kinase  29.94 
 
 		 342 aa  89.4  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0083  signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 470 aa  89.4  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  28.24 
 
 		 531 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>