224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4440 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4440  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  358  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3253  TetR family transcriptional regulator  80.75 
 
 		 205 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  32.37 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  41.67 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  37.33 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  24.52 
 
 		 251 aa  48.5  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 255 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 540 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  30.66 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  26.01 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 243 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  40.7 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  51.28 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 219 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 212 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 193 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  31.1 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  25.81 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  36.44 
 
 		 403 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>