More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1208 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  84.55 
 
 		 233 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  74.25 
 
 		 232 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  69.53 
 
 		 230 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  61.11 
 
 		 237 aa  281  7.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  58.37 
 
 		 234 aa  281  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  59.83 
 
 		 237 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  58.67 
 
 		 233 aa  278  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  57.51 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  57.94 
 
 		 236 aa  267  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  58.37 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  59.66 
 
 		 236 aa  264  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  58.12 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  54.66 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  56.41 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  55.46 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  52.79 
 
 		 240 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  57.26 
 
 		 236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  54.01 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  53.22 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  55.79 
 
 		 234 aa  248  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  52.36 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  53.85 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  53.85 
 
 		 237 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.68 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  53.88 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  53.88 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  53.22 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  54.08 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  53.65 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  53.65 
 
 		 236 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  51.93 
 
 		 237 aa  238  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  50 
 
 		 243 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  50.21 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  52.36 
 
 		 235 aa  235  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  50.21 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  48.93 
 
 		 237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  52.99 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  52.99 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  53.22 
 
 		 235 aa  232  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  52.56 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  50.64 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  48.5 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  50.85 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  51.71 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  48.5 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.5 
 
 		 233 aa  228  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  48.5 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  48.28 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  224  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  46.78 
 
 		 231 aa  225  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  48.07 
 
 		 246 aa  224  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  49.13 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  48.46 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  48.9 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  49.79 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  49.36 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.44 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  51.07 
 
 		 229 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 230 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  49.36 
 
 		 237 aa  218  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  49.79 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  48.44 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  52.79 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  45.06 
 
 		 232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  46.12 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  45.91 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.36 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  50.64 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.07 
 
 		 235 aa  208  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  46.85 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  45.3 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  45.89 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  45.96 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  45.26 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  47.21 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  42.37 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  50 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.35 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  47.21 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  45.11 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2315  ABC transporter related  43.29 
 
 		 233 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  48.95 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  52.13 
 
 		 246 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  45.7 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  49.57 
 
 		 236 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  44.21 
 
 		 237 aa  201  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0776  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  44.64 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1835  ABC transporter  44.16 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.020378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  44.4 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3627  ABC transporter related  43.29 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  45.8 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>