More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2029 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
417 aa  861    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03093  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44.76 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3284  ATP-dependent RNA helicase SrmB  42.05 
 
 
412 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3679  ATP-dependent RNA helicase SrmB  43.5 
 
 
441 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0397087  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3601  ATP-dependent RNA helicase SrmB  43.5 
 
 
441 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1126  ATP-dependent RNA helicase SrmB  43.5 
 
 
441 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1179  ATP-dependent RNA helicase SrmB  43.5 
 
 
441 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0890  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.77 
 
 
408 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0724766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0892  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.77 
 
 
408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9005  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0660  ATP-dependent RNA helicase SrmB  40.85 
 
 
406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1195  ATP-dependent RNA helicase SrmB  42.75 
 
 
441 aa  306  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000749506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3080  ATP-dependent RNA helicase SrmB  42.25 
 
 
441 aa  305  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0767  ATP-dependent RNA helicase SrmB  42.56 
 
 
419 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0735156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.8 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000976473  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0802  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.51 
 
 
411 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2837  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44 
 
 
444 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2753  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44 
 
 
444 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.902304  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2858  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44 
 
 
444 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.197769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  41.99 
 
 
452 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2971  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44 
 
 
444 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2855  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44 
 
 
444 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0723995  normal  0.849039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0840  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.65 
 
 
419 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3527  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.65 
 
 
419 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3452  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.65 
 
 
419 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2794  ATP-dependent RNA helicase SrmB  43.25 
 
 
446 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.228355  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00952  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.89 
 
 
407 aa  299  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3646  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.65 
 
 
419 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1059  ATP-dependent RNA helicase SrmB  42.5 
 
 
450 aa  299  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0187648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.11 
 
 
430 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2944  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44.7 
 
 
444 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4097  ATP-dependent RNA helicase SrmB  42.21 
 
 
417 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.872576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02470  ATP-dependent RNA helicase  44.44 
 
 
444 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02434  hypothetical protein  44.44 
 
 
444 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2863  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44.44 
 
 
444 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0202971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3813  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44.44 
 
 
444 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152384  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1101  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44.44 
 
 
444 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077358  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2729  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44.44 
 
 
444 aa  296  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0618192  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2732  ATP-dependent RNA helicase SrmB  44.44 
 
 
444 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.500334  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1092  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.44 
 
 
444 aa  296  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.424436  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2742  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.25 
 
 
613 aa  296  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004445  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.08 
 
 
407 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0454053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3336  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.65 
 
 
419 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0887  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.39 
 
 
419 aa  293  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.15 
 
 
456 aa  293  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0744  ATP-dependent RNA helicase SrmB  40.77 
 
 
411 aa  292  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3233  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.39 
 
 
420 aa  292  7e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0790  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.39 
 
 
420 aa  292  9e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0191  ATP-dependent RNA helicase SrmB  40.85 
 
 
423 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.85 
 
 
450 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0947  ATP-dependent RNA helicase SrmB  41.13 
 
 
420 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0558  ATP-dependent RNA helicase SrmB  40.78 
 
 
416 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3036  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  40.25 
 
 
453 aa  289  7e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  38.07 
 
 
435 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  40.3 
 
 
472 aa  287  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  40.47 
 
 
533 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2514  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.36 
 
 
449 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.49 
 
 
502 aa  286  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0263323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.95 
 
 
632 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0169  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.1 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0187  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.1 
 
 
453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2445  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.1 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.959093  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2444  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.1 
 
 
449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2606  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.45 
 
 
449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.581519  hitchhiker  0.0000000487661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1417  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.21 
 
 
468 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0306268  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2838  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.41 
 
 
449 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3053  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.57 
 
 
447 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643926  normal  0.011472 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.61 
 
 
634 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1295  ATP-dependent RNA helicase SrmB  40.53 
 
 
441 aa  281  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1645  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.86 
 
 
451 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1682  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.86 
 
 
451 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.747215  normal  0.719236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.32 
 
 
465 aa  279  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.509668  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1660  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.86 
 
 
451 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2698  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.86 
 
 
451 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  hitchhiker  0.0000852127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.9 
 
 
454 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3215  putative ATP-dependent RNA helicase SrmB  37.31 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.571925  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.47 
 
 
556 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.871756 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.12 
 
 
627 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.12 
 
 
627 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.38 
 
 
421 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1883  DEAD/DEAH box helicase-like  40 
 
 
401 aa  273  6e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2624  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.74 
 
 
448 aa  272  7e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394652  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1537  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.56 
 
 
449 aa  271  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.713304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0838  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  38.38 
 
 
403 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0794098  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.8 
 
 
512 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394714  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 
512 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.66 
 
 
441 aa  268  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  38.27 
 
 
608 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 
514 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632287 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5356  DEAD/DEAH box helicase  37.62 
 
 
516 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1999  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.56 
 
 
482 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1230  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 
505 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.802286  normal  0.130037 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2047  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.62 
 
 
516 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6030  DEAD/DEAH box helicase-like  37.62 
 
 
516 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1618  DEAD/DEAH box helicase-like  37.62 
 
 
447 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2523  DEAD/DEAH box helicase  37.56 
 
 
513 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.239801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.59 
 
 
448 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00759671  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1359  DEAD/DEAH box helicase  37.56 
 
 
516 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.87 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000327397 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3226  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.56 
 
 
516 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2086  DEAD/DEAH box helicase  37.56 
 
 
516 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>