157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2257 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  566  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  27.2 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  27.82 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  30.35 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  26.75 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  45.07 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  39.17 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 241 aa  67  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  26.21 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  31.93 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  36.52 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  38.14 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  28.05 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  33.33 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  24.44 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  35.92 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  40 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  27.57 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  34.21 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  30.61 
 
 		 347 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  27.57 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  30.61 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  41.67 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  40 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  38.55 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  30.69 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  32.29 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0882  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.703197  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  29.06 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1666  XRE family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0895  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000331112 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  23.75 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  25.57 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  26.53 
 
 		 565 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3060  SH3 type 3 domain-containing protein  40 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  31.62 
 
 		 436 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  24.1 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  27.52 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  27.52 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  29.03 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 		 296 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  29.29 
 
 		 342 aa  52.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  28.81 
 
 		 361 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  28.81 
 
 		 361 aa  52.4  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3243  hypothetical protein  34.78 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.548156  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  28.81 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  28.81 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  34.48 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  31.76 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  47.69 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  31.71 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  26.52 
 
 		 374 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  24.05 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0223  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 315 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4506  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0632978  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  27.59 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  31.71 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0785  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 501 aa  49.7  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0234796  normal  0.197603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  26.38 
 
 		 327 aa  49.3  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  29.57 
 
 		 380 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  29.57 
 
 		 375 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  48.9  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00827642  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  29.57 
 
 		 376 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  24.84 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  24.84 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  36.62 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  25.28 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  26.24 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  25.75 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1183  hypothetical protein  29.9 
 
 		 409 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.297554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  24.84 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10680  hypothetical protein  30.95 
 
 		 469 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0331666  unclonable  0.0000000019821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0913  hypothetical protein  40.98 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.373536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  30.67 
 
 		 340 aa  47.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  24.73 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  26.24 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  27.07 
 
 		 393 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3162  response regulator receiver protein  31.51 
 
 		 450 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  21.37 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  24.26 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1821  hypothetical protein  26.38 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0124025  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  26.98 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1009  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 199 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1790  hypothetical protein  34.67 
 
 		 165 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>