More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0333 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0333  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  280  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.800894  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1533  LuxR family transcriptional regulator  60.63 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.717435  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2289  regulatory protein LuxR  37.78 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2902  LuxR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.02 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2246  regulatory protein, LuxR  50.75 
 
 		 899 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1571  XRE family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.49 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.18 
 
 		 913 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.45 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1965  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.87 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 921 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 921 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 921 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2722  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.53 
 
 		 947 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  51.61 
 
 		 873 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.15 
 
 		 922 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.82 
 
 		 1019 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50.82 
 
 		 894 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.03 
 
 		 258 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.265474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  35.85 
 
 		 217 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0218  two component LuxR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 339 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  42.86 
 
 		 900 aa  60.5  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 947 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 212 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  45.95 
 
 		 218 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0897  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  50 
 
 		 933 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.571021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  35.24 
 
 		 221 aa  60.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 221 aa  60.1  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 218 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3598  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 218 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329097  normal  0.731815 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  47.54 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  39.77 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  45.9 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1496  LuxR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 514 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.25 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6717  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 509 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.45 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  47.54 
 
 		 896 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.05 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 514 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6457  LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 570 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6692  LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 570 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  50.94 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5403  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.497351  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 510 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2514  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.135771  normal  0.887193 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01037  DNA-binding transcriptional activator in two-component regulatory system  47.54 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01044  hypothetical protein  47.54 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2341  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.6 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.193906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4854  putative two component LuxR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.26 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.253855  normal  0.0592312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2469  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.23 
 
 		 860 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  44.62 
 
 		 887 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6046  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 502 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  50 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.04 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0978  two component signal transduction response regulator  44.26 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402933  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1600  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.240626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  45 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17000  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.39 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0169  transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  45.16 
 
 		 917 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 489 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2048  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  47.54 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0804096  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  43.48 
 
 		 879 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2231  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  47.54 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.750523  normal  0.99411 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1208  DNA-binding transcriptional regulator CsgD  47.54 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316434  normal  0.419874 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  52.46 
 
 		 891 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6529  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270807  normal  0.114568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>