285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0061 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0061  peptidase S41  100 
 
 
441 aa  883    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.830386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1489  peptidase S41  39.73 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1724  peptidase S41  36.07 
 
 
335 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0570735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8877  peptidase S41  42 
 
 
301 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0871  peptidase S41  31.51 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.736604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00358  peptidase, S41 family  32.4 
 
 
348 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3539  peptidase S41  33.44 
 
 
298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0412069  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  28.7 
 
 
337 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6781  peptidase S41  33.16 
 
 
347 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0655  peptidase S41  30.97 
 
 
329 aa  90.9  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0487993 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  31.38 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  30.32 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  26.64 
 
 
470 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 
377 aa  63.5  0.000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 
379 aa  63.2  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  28.22 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  28.22 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  28.64 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  29.67 
 
 
402 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  29.67 
 
 
402 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  28.8 
 
 
401 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  29.31 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  28.27 
 
 
426 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  28.14 
 
 
401 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  30.85 
 
 
465 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  28.96 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  31.43 
 
 
421 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  31.16 
 
 
455 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  29.33 
 
 
472 aa  60.1  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  27.68 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  29.51 
 
 
401 aa  59.7  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  27.72 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  31.5 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  27.8 
 
 
401 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  33.09 
 
 
566 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 
423 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  30.17 
 
 
440 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  27.65 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  28.34 
 
 
472 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  30.81 
 
 
569 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  29.41 
 
 
341 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  27.51 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  32.28 
 
 
396 aa  57.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  29.01 
 
 
721 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1994  C-terminal processing peptidase  26.98 
 
 
404 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.72907  normal  0.0163388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  27.47 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 
437 aa  57.4  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  27.5 
 
 
710 aa  57  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 
494 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  27.57 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  25.82 
 
 
442 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  30.05 
 
 
438 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  29.61 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  34.03 
 
 
483 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  27.45 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  28 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  30.15 
 
 
550 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  31.43 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  28.78 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  30.41 
 
 
449 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 
438 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  30.34 
 
 
538 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 
438 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 
438 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
498 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  26.29 
 
 
389 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  28.25 
 
 
477 aa  53.9  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  25.41 
 
 
401 aa  53.9  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 
437 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  31.3 
 
 
557 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  29.75 
 
 
472 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  29.26 
 
 
428 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  30.34 
 
 
550 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  25.77 
 
 
441 aa  53.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  29.5 
 
 
439 aa  53.5  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  27.86 
 
 
438 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  28.87 
 
 
428 aa  53.5  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  28.72 
 
 
457 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  25.91 
 
 
445 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  28.09 
 
 
446 aa  53.1  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 
422 aa  53.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  28.5 
 
 
432 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  26.29 
 
 
383 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  25.91 
 
 
445 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  29.78 
 
 
532 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  25.57 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  28.73 
 
 
407 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  26.73 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1321  carboxyl-terminal protease  27.47 
 
 
704 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184977  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1027  peptidase S41  30.39 
 
 
509 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0560517  normal  0.0627841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  26.53 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  26.97 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  27.34 
 
 
444 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  27.8 
 
 
547 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  28.18 
 
 
524 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  28.18 
 
 
530 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  24.88 
 
 
441 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  29.71 
 
 
535 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1268  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 
693 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000748265  normal  0.0247488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>