More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_21240 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 358 aa  669    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.58 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.72 
 
 		 382 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  39.09 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.6 
 
 		 361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  35.1 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  35.89 
 
 		 374 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  36.61 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  39.49 
 
 		 361 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.27 
 
 		 377 aa  123  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  35.58 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  35.58 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  39.36 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 347 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  40.17 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  38.68 
 
 		 358 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  34.19 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  34.59 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  36.25 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  41.67 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  34.68 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  39.03 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  36.4 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  34.52 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0342  Polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.249196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  38.22 
 
 		 384 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  33.98 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  40.42 
 
 		 634 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  37.06 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  37.29 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  34.78 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  41.6 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 385 aa  112  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  33.52 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  33.65 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  36.61 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  35.03 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  33.81 
 
 		 1155 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  36.92 
 
 		 368 aa  110  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  31.69 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  34.91 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  34.91 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  34.91 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  36.6 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  28.38 
 
 		 332 aa  107  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  26.44 
 
 		 332 aa  106  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.21 
 
 		 362 aa  105  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  40 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  37.71 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  38.8 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  25.92 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  28.97 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  34.62 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  34.62 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  29.48 
 
 		 325 aa  103  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.62 
 
 		 373 aa  102  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  29.51 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  27.64 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  34.19 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  31.91 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  35.06 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  30.13 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  35 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  31.31 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  26.42 
 
 		 313 aa  99.8  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  32.23 
 
 		 320 aa  99.8  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  35.62 
 
 		 297 aa  99.4  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  31.65 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  33.94 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  35.86 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  38.58 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  40.98 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.34 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  35.19 
 
 		 297 aa  97.8  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  30.74 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  30.74 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  30.74 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  35.19 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  28 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  30.17 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  38.92 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  35.15 
 
 		 342 aa  96.3  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  29.84 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.09 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  26.64 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  31.44 
 
 		 322 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  33.46 
 
 		 327 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  38.76 
 
 		 362 aa  94  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0771  polyprenyl-diphosphate synthase  33.33 
 
 		 297 aa  94.4  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  30.21 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  23.91 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  29.18 
 
 		 331 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  26.93 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  33.57 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  30.42 
 
 		 331 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  24.58 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  33.82 
 
 		 338 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>