123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1767 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1767  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  568  1e-161  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  29.01 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  26.64 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  26.64 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 
412 aa  72.8  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.378287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  26.12 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  31.43 
 
 
140 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0255  UspA domain protein  26.21 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955091  normal  0.331109 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  25.97 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  22.97 
 
 
283 aa  62.4  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  27.87 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 
141 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  23.47 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.17 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  25.81 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  30.17 
 
 
286 aa  55.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  30.28 
 
 
141 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  28.3 
 
 
157 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  27.07 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  25.34 
 
 
142 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  23.72 
 
 
304 aa  52.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  22.68 
 
 
449 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  25.43 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  25.43 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 
143 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 
294 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  23.12 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
140 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  23.84 
 
 
293 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.27 
 
 
143 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  26.26 
 
 
280 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  26.14 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  23.87 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 
148 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  27.78 
 
 
144 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  26.43 
 
 
140 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 
147 aa  48.9  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  22.97 
 
 
297 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 
140 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  21.32 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  23.96 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  33.1 
 
 
148 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  25.84 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  29.63 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  20.89 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  26.49 
 
 
144 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  28.28 
 
 
144 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  24.41 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 
146 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  22.62 
 
 
287 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  28.97 
 
 
144 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  27.01 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  23.37 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  25.83 
 
 
144 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  25.69 
 
 
149 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  23.4 
 
 
320 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  30.23 
 
 
296 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  28.28 
 
 
144 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  25.23 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  24.63 
 
 
145 aa  46.6  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  25.83 
 
 
144 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  21.43 
 
 
297 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  25.83 
 
 
144 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  24.14 
 
 
153 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  31.82 
 
 
281 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
145 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  27.04 
 
 
167 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  30 
 
 
155 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  28.26 
 
 
146 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
144 aa  45.8  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  25.76 
 
 
153 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.06 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  27.52 
 
 
156 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  26.12 
 
 
145 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  25.18 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  24.64 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 
144 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  28.15 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  25.18 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  23.53 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  24.84 
 
 
157 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  25.17 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  25.17 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  25 
 
 
153 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  30.97 
 
 
159 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
148 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  25.17 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  25.17 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  25.17 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  25.17 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  25.17 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.09 
 
 
128 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  22.11 
 
 
287 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2244  UspA domain protein  20.62 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.616395 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2182  UspA domain protein  20.62 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  28.79 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  36.21 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  21.48 
 
 
276 aa  44.3  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>