99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4718 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  84.75 
 
 		 243 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  72.57 
 
 		 235 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  77.72 
 
 		 274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  77.72 
 
 		 217 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  74.64 
 
 		 211 aa  319  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 201 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 203 aa  131  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  28.1 
 
 		 187 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 205 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 197 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 202 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 227 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  27.12 
 
 		 192 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 200 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 190 aa  45.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 203 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  20.47 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6153  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  23.01 
 
 		 177 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 191 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 193 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 216 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 178 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 193 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 200 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_126  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 205 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  41.3 
 
 		 184 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.39 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 193 aa  42.4  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 211 aa  42.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  30.56 
 
 		 204 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 189 aa  42.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 203 aa  42.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 194 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0252  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 212 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 210 aa  42  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 206 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 201 aa  42  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 188 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>