More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl232 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl232  structural maintenance of chromosomes smc superfamily protein  100 
 
 
995 aa  1996    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0495  structural maintenance of chromosomes (SMC) superfamily protein  50.66 
 
 
988 aa  966    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.210313  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0156  p115 protein  34.72 
 
 
981 aa  521  1e-146  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  33.63 
 
 
978 aa  520  1e-146  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  29.78 
 
 
1191 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  27.33 
 
 
1164 aa  322  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  31.01 
 
 
1187 aa  311  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  29 
 
 
1189 aa  300  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  30.57 
 
 
1189 aa  295  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  30.7 
 
 
1189 aa  291  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  30.28 
 
 
1190 aa  262  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.11 
 
 
1177 aa  252  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  27.35 
 
 
1177 aa  241  5e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  27.47 
 
 
1170 aa  238  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  32.76 
 
 
1189 aa  232  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  32.76 
 
 
1189 aa  232  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  32.76 
 
 
1189 aa  232  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  32.76 
 
 
1189 aa  232  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  32.76 
 
 
1189 aa  231  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  32.76 
 
 
1189 aa  231  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  40.96 
 
 
1187 aa  231  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  32.59 
 
 
1189 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  32.51 
 
 
1189 aa  228  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  38.62 
 
 
1185 aa  227  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  38.65 
 
 
1187 aa  223  9.999999999999999e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  40.19 
 
 
1188 aa  219  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  40.19 
 
 
1188 aa  219  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  45.76 
 
 
1189 aa  218  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  38.87 
 
 
1196 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  26.36 
 
 
1201 aa  213  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  45.45 
 
 
1185 aa  213  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  34.92 
 
 
1133 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  43.51 
 
 
1185 aa  207  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  46.06 
 
 
1162 aa  207  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  42.57 
 
 
1179 aa  206  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  46.06 
 
 
1162 aa  207  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  41 
 
 
1190 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  43.1 
 
 
1185 aa  206  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  38.64 
 
 
1162 aa  205  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  38.64 
 
 
1162 aa  205  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  46.19 
 
 
1162 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  39.16 
 
 
1164 aa  204  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  35.11 
 
 
1301 aa  204  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  38.31 
 
 
1162 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  38.21 
 
 
1162 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  29.45 
 
 
1173 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  43.67 
 
 
1185 aa  202  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  43.15 
 
 
1162 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  45.69 
 
 
1190 aa  202  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  31.3 
 
 
1195 aa  202  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  39.08 
 
 
1198 aa  201  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  37.66 
 
 
1162 aa  201  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  35.77 
 
 
1174 aa  200  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  31.81 
 
 
1255 aa  199  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.02 
 
 
1194 aa  198  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  37.33 
 
 
1163 aa  197  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  39.04 
 
 
1140 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  27.32 
 
 
1164 aa  197  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  43.61 
 
 
1162 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  31.68 
 
 
1186 aa  196  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.03 
 
 
1134 aa  196  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  26.79 
 
 
1164 aa  196  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  43.61 
 
 
1162 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  33.41 
 
 
1168 aa  195  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  38.89 
 
 
1175 aa  194  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  31.1 
 
 
1145 aa  193  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  36.39 
 
 
1186 aa  193  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  30.14 
 
 
1142 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  30.38 
 
 
1142 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  40.43 
 
 
1176 aa  193  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  42.68 
 
 
1170 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  35.51 
 
 
1175 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  34.05 
 
 
1138 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  34.45 
 
 
1177 aa  191  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  30.88 
 
 
1175 aa  191  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  38.31 
 
 
1142 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  33.53 
 
 
1138 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  33.33 
 
 
1318 aa  191  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  32.8 
 
 
1141 aa  190  9e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  42.53 
 
 
1307 aa  189  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  40 
 
 
1280 aa  189  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  41.08 
 
 
1176 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  33.78 
 
 
1138 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  36.87 
 
 
1184 aa  189  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  36.75 
 
 
1175 aa  188  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  45.95 
 
 
1204 aa  189  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  37.4 
 
 
1138 aa  188  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  36.59 
 
 
1164 aa  188  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  41.05 
 
 
1176 aa  187  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  32.88 
 
 
1139 aa  187  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  36.13 
 
 
1174 aa  187  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  41.55 
 
 
1144 aa  187  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  35.13 
 
 
1174 aa  187  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  35.94 
 
 
1145 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  38.66 
 
 
1176 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  38.66 
 
 
1176 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  32.74 
 
 
1171 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  38.41 
 
 
299 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  44.44 
 
 
1181 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  42.2 
 
 
1138 aa  186  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>