160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4331 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4331  conjugal transfer coupling protein TraG  100 
 
 		 639 aa  1319    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0647  conjugal transfer coupling protein TraG  75.79 
 
 		 637 aa  1023    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.600969  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5000  conjugal transfer coupling protein TraG  81.2 
 
 		 635 aa  1060    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.763698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7061  conjugal transfer coupling protein TraG  47.92 
 
 		 655 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9186  conjugal transfer coupling protein TraG  43.56 
 
 		 656 aa  492  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.995414  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9589  conjugal transfer coupling protein TraG  44.99 
 
 		 629 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5517  conjugal transfer coupling protein TraG  46.86 
 
 		 665 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112559 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5396  conjugal transfer coupling protein TraG  46.67 
 
 		 639 aa  469  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.457132 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8128  conjugal transfer coupling protein TraG  46.56 
 
 		 654 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147947  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4672  conjugal transfer coupling protein TraG  44.4 
 
 		 641 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.811781  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6100  conjugal transfer coupling protein TraG  42.39 
 
 		 663 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5572  conjugal transfer coupling protein TraG  43.5 
 
 		 674 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0224305  normal  0.0294254 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4242  conjugal transfer coupling protein TraG  37.91 
 
 		 682 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0995866  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3531  conjugal transfer coupling protein TraG  40.59 
 
 		 606 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  28.02 
 
 		 662 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  27.39 
 
 		 661 aa  120  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  27.13 
 
 		 663 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  27.96 
 
 		 665 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  27.33 
 
 		 661 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  27.1 
 
 		 660 aa  118  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  27.39 
 
 		 666 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  26.57 
 
 		 662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  27.94 
 
 		 662 aa  115  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  28.3 
 
 		 666 aa  114  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0535  TRAG family protein  27.23 
 
 		 509 aa  114  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.379254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  27.71 
 
 		 663 aa  114  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  27.71 
 
 		 663 aa  114  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  27.52 
 
 		 661 aa  113  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  26.89 
 
 		 669 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  27.71 
 
 		 661 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  26.4 
 
 		 560 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  27.21 
 
 		 660 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  27.97 
 
 		 666 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  27.29 
 
 		 659 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  28.02 
 
 		 661 aa  112  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  25.56 
 
 		 664 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  27.22 
 
 		 661 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  27.78 
 
 		 700 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6559  TRAG family protein  25.3 
 
 		 561 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  25.65 
 
 		 668 aa  108  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  27 
 
 		 663 aa  108  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  27.45 
 
 		 674 aa  107  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  26.36 
 
 		 676 aa  107  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  26.16 
 
 		 687 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1970  TRAG family protein  24.51 
 
 		 580 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  26.23 
 
 		 661 aa  107  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  26.34 
 
 		 664 aa  107  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  27.91 
 
 		 659 aa  107  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  26.8 
 
 		 660 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  27.64 
 
 		 687 aa  105  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  27.46 
 
 		 666 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  26.77 
 
 		 665 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  26.74 
 
 		 665 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  26.54 
 
 		 675 aa  101  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  27.23 
 
 		 664 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  26.54 
 
 		 669 aa  101  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  26.54 
 
 		 669 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  27 
 
 		 665 aa  100  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  26.51 
 
 		 670 aa  99.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  24.12 
 
 		 661 aa  99.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  24.16 
 
 		 695 aa  99.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  26.74 
 
 		 673 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  26.54 
 
 		 667 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  26.09 
 
 		 672 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0047  TraG/TraD family protein  23.25 
 
 		 620 aa  98.6  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  26.76 
 
 		 666 aa  99  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  26.09 
 
 		 669 aa  98.6  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  23.15 
 
 		 699 aa  97.8  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  24.45 
 
 		 554 aa  97.1  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  25.86 
 
 		 660 aa  96.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  24.37 
 
 		 678 aa  95.1  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  23.64 
 
 		 583 aa  94  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  27 
 
 		 664 aa  93.6  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  25.12 
 
 		 723 aa  91.3  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0593  TRAG protein  23.73 
 
 		 575 aa  91.3  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  23.81 
 
 		 648 aa  89.7  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  22.67 
 
 		 699 aa  89.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  22.4 
 
 		 723 aa  89  3e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  23.06 
 
 		 713 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  22.63 
 
 		 714 aa  87.8  5e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  23.21 
 
 		 641 aa  87.4  7e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  26.32 
 
 		 573 aa  87.4  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  22.27 
 
 		 575 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  22.33 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  27.25 
 
 		 670 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  24.77 
 
 		 823 aa  80.9  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  24.94 
 
 		 670 aa  80.5  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6326  TRAG family protein  22.35 
 
 		 588 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  23.67 
 
 		 678 aa  79.7  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  22.59 
 
 		 594 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  25.47 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6334  TRAG family protein  26.32 
 
 		 897 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0262  TRAG family protein  24.15 
 
 		 809 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.963876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  22.75 
 
 		 603 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0479  TRAG family protein  27.12 
 
 		 531 aa  76.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  23.56 
 
 		 756 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2342  TRAG family protein  25.89 
 
 		 585 aa  76.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.910402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  21.57 
 
 		 714 aa  75.1  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1398  TRAG family protein  24.01 
 
 		 828 aa  75.5  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.277319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3603  Type IV secretory pathway VirD4 components-like protein  36.13 
 
 		 129 aa  75.5  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.720206  normal  0.831231 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>