188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0970 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0970  integrase family protein  100 
 
 		 367 aa  754    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605472  normal  0.569329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0969  integrase family protein  63.22 
 
 		 426 aa  428  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  43.6 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  43.6 
 
 		 370 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  46.55 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4758  integrase family protein  40.44 
 
 		 405 aa  248  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  40.39 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6147  Integrase  40.3 
 
 		 344 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0140  phage integrase family protein  35.71 
 
 		 375 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0619  phage integrase family protein  40.24 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0812  integrase family protein  34.87 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.427445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6744  putative phage integrase  32.7 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0831  phage integrase family protein  32.95 
 
 		 362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  33.53 
 
 		 346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7358  integrase family protein  32.45 
 
 		 344 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0826  phage integrase family protein  35.53 
 
 		 294 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2857  phage integrase  31.41 
 
 		 359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1951  phage-related integrase  27.11 
 
 		 343 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242299  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2080  putative tyrosine recombinase  33.22 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.524732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3065  phage integrase family protein  35.94 
 
 		 361 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2161  phage integrase family protein  29.13 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1076  integrase  33.85 
 
 		 250 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0676  phage integrase family protein  34.11 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1968  integrase/recombinase  34.11 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0961  phage integrase family protein  29.88 
 
 		 359 aa  109  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178489  normal  0.193987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2644  phage integrase family protein  31.07 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00120469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3849  phage integrase family protein  30 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  29.51 
 
 		 361 aa  94  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1662  integrase/recombinase  31.65 
 
 		 348 aa  92.8  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0125485  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  27.22 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  25.26 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_004310  BR1474  phage integrase family site specific recombinase  36.07 
 
 		 164 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  26.18 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  25.23 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1428  phage integrase family site specific recombinase  36.44 
 
 		 125 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3588  phage integrase  33.99 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.385994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  26.53 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  22.88 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1177  integrase family protein  23.75 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  24.76 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3728  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.315534  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  26.41 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1966  integrase family protein  28.21 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  29.17 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  28.7 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1133  integrase family protein  25.7 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  24.19 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0755  putative tyrosine recombinase  40.79 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313446  normal  0.431565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  24.35 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.92 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0966  phage integrase family site specific recombinase  22.63 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.832131  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  27.67 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  29.05 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.11 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  26.48 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  19.92 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1692  phage integrase  24.19 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.50677 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0306  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.11 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  21.47 
 
 		 345 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1918  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1924  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  23.53 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  20.24 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  24.55 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 303 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.94 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  29.86 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  25.85 
 
 		 288 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  25.78 
 
 		 283 aa  50.4  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.3 
 
 		 296 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2583  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1948  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2559  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1488  tyrosine recombinase XerD  27.48 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.57 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  28.7 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  23.43 
 
 		 290 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  25.22 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  23.45 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  23.45 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  23.45 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  26.42 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1378  site-specific recombinase XerD-like  24.24 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.106442  normal  0.166813 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  24.04 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  24.04 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  27.06 
 
 		 321 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  21.17 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5891  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 		 316 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  29.9 
 
 		 295 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  21.21 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  21.46 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  22.27 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  23.74 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>