More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3059 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  62.25 
 
 		 909 aa  976    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 879 aa  1726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  61.79 
 
 		 909 aa  972    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  84.01 
 
 		 883 aa  1392    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  61.54 
 
 		 947 aa  970    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  58.95 
 
 		 910 aa  951    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  39.17 
 
 		 853 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  36.25 
 
 		 866 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 860 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 		 832 aa  385  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 874 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 845 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 835 aa  315  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  32.78 
 
 		 840 aa  310  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  32.91 
 
 		 840 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  30.38 
 
 		 825 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  29.4 
 
 		 825 aa  302  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 859 aa  301  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 		 815 aa  301  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 856 aa  294  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 867 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  31.79 
 
 		 820 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 		 843 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  29.82 
 
 		 803 aa  277  6e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 809 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 844 aa  274  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 		 803 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 855 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  29.89 
 
 		 806 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 817 aa  258  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 803 aa  257  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  30.07 
 
 		 807 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  28.17 
 
 		 815 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 868 aa  247  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  29.07 
 
 		 832 aa  246  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  28.82 
 
 		 814 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  45.35 
 
 		 840 aa  239  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  28.78 
 
 		 804 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 815 aa  238  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 832 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 814 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  27.61 
 
 		 817 aa  232  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  30.57 
 
 		 799 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 820 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 820 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  30.31 
 
 		 809 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.31 
 
 		 809 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  30.31 
 
 		 809 aa  227  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  28.67 
 
 		 814 aa  227  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 		 796 aa  227  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  30.31 
 
 		 808 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.64 
 
 		 773 aa  225  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  28.31 
 
 		 816 aa  225  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  28.06 
 
 		 803 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  41.16 
 
 		 849 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  41.91 
 
 		 847 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  41.91 
 
 		 847 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 794 aa  212  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  39.46 
 
 		 830 aa  209  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  27.1 
 
 		 813 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  37.32 
 
 		 806 aa  192  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  32.49 
 
 		 891 aa  191  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 785 aa  190  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 752 aa  188  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  34.19 
 
 		 877 aa  184  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  33.45 
 
 		 753 aa  157  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  34.53 
 
 		 732 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 		 1235 aa  156  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  38.91 
 
 		 472 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  32.92 
 
 		 1080 aa  154  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 1127 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  36.68 
 
 		 291 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.12 
 
 		 1144 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 807 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  36.44 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  37.16 
 
 		 1158 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 298 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 1072 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  33.57 
 
 		 795 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 1072 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 1072 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 1067 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  37.02 
 
 		 1105 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  34.7 
 
 		 1117 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  36.18 
 
 		 816 aa  146  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  33.8 
 
 		 1117 aa  146  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  34.43 
 
 		 1067 aa  145  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 		 981 aa  145  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1107 aa  145  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  35.77 
 
 		 1111 aa  144  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  37.05 
 
 		 636 aa  144  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  33.22 
 
 		 842 aa  144  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 843 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 1067 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  33.44 
 
 		 1078 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  33.82 
 
 		 1115 aa  143  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 		 1066 aa  142  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  32.31 
 
 		 1060 aa  142  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 		 864 aa  142  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  31.11 
 
 		 299 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>