107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2219 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2219  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 152 aa  303  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  29.32 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  37.37 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 167 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  31.94 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3385  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.824794  hitchhiker  0.00000813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2462  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0843644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2182  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2527  transcriptional regulator, MarR family  24.51 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000236646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2221  MarR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014883  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  26.61 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 202 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 315 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  30.36 
 
 		 324 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3484  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643399  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 155 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 161 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  28.77 
 
 		 161 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 145 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 158 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 159 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 162 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  32.76 
 
 		 283 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0559  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.68 
 
 		 308 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2534  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  27.45 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 161 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  27.59 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>