More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1770 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  47.98 
 
 		 952 aa  687    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  52.04 
 
 		 874 aa  738    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  100 
 
 		 949 aa  1914    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  51.74 
 
 		 974 aa  816    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  43.7 
 
 		 934 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  44.21 
 
 		 811 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.87 
 
 		 824 aa  571  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.16 
 
 		 972 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  41.57 
 
 		 988 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  41.39 
 
 		 928 aa  561  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  43.92 
 
 		 875 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  42.05 
 
 		 923 aa  551  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.04 
 
 		 851 aa  519  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  38.55 
 
 		 999 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.26 
 
 		 927 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  32.11 
 
 		 972 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  29.02 
 
 		 881 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  28.81 
 
 		 893 aa  266  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  26.69 
 
 		 875 aa  236  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  30.2 
 
 		 914 aa  217  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.76 
 
 		 820 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  34.81 
 
 		 902 aa  202  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.55 
 
 		 889 aa  201  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.18 
 
 		 712 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  41.23 
 
 		 849 aa  190  8e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  37.62 
 
 		 882 aa  190  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  38.15 
 
 		 882 aa  189  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  25.74 
 
 		 866 aa  186  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  30.91 
 
 		 864 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  25.32 
 
 		 870 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  33.78 
 
 		 733 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  34.76 
 
 		 904 aa  181  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  33.91 
 
 		 898 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  32.03 
 
 		 905 aa  177  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  32.44 
 
 		 717 aa  175  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  24.74 
 
 		 857 aa  174  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.22 
 
 		 1212 aa  169  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  31.99 
 
 		 747 aa  167  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  23.93 
 
 		 887 aa  165  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  34.57 
 
 		 966 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  35.47 
 
 		 808 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.96 
 
 		 805 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.05 
 
 		 1343 aa  149  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  32.77 
 
 		 1037 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  31.19 
 
 		 803 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  28.15 
 
 		 1548 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  31.93 
 
 		 763 aa  136  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  32.72 
 
 		 778 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.75 
 
 		 1357 aa  135  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  32.05 
 
 		 777 aa  134  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  32.41 
 
 		 778 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.72 
 
 		 762 aa  134  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.1 
 
 		 760 aa  133  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.14 
 
 		 784 aa  132  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.91 
 
 		 795 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.96 
 
 		 792 aa  131  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.2 
 
 		 756 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.35 
 
 		 757 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  31.87 
 
 		 823 aa  130  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.39 
 
 		 782 aa  128  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  31.98 
 
 		 772 aa  127  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  37.11 
 
 		 915 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  34.17 
 
 		 693 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  29.78 
 
 		 886 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  24.78 
 
 		 738 aa  125  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  32.76 
 
 		 845 aa  125  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  32.3 
 
 		 763 aa  124  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  31.32 
 
 		 774 aa  124  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.14 
 
 		 766 aa  124  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  31.62 
 
 		 763 aa  124  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.16 
 
 		 807 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  29.85 
 
 		 721 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.05 
 
 		 738 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  32.88 
 
 		 740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.61 
 
 		 771 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  32.81 
 
 		 764 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  28.36 
 
 		 765 aa  122  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  28.68 
 
 		 765 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  28.68 
 
 		 765 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  28.68 
 
 		 765 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  30.77 
 
 		 763 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.86 
 
 		 814 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  28.36 
 
 		 765 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  30.75 
 
 		 737 aa  121  7e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  30.97 
 
 		 758 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 		 755 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  29.18 
 
 		 721 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  30.77 
 
 		 763 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1525  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.42 
 
 		 765 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  28.42 
 
 		 765 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3257  beta-glucosidase, periplasmic  28.11 
 
 		 765 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621974 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.43 
 
 		 806 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.16 
 
 		 752 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  28.42 
 
 		 765 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  30.65 
 
 		 766 aa  120  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  29.59 
 
 		 722 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.29 
 
 		 749 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  30.48 
 
 		 763 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.25 
 
 		 750 aa  119  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.59 
 
 		 902 aa  119  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>