More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2786 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  100 
 
 
481 aa  942    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1226  hypothetical protein  46.74 
 
 
232 aa  126  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0446025  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  48.08 
 
 
240 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  47.66 
 
 
217 aa  101  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  47.66 
 
 
217 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  50.96 
 
 
244 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 
335 aa  99  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.75 
 
 
478 aa  96.3  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  47.75 
 
 
239 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  47.75 
 
 
239 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  46.85 
 
 
264 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  39.2 
 
 
229 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  42.37 
 
 
233 aa  94.4  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 
219 aa  93.2  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  39.52 
 
 
229 aa  92  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 
210 aa  91.3  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 
218 aa  89.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 
218 aa  89.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 
261 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 
209 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  36.03 
 
 
236 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  42.5 
 
 
344 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
242 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 
219 aa  89  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  40 
 
 
407 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.93 
 
 
429 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.53 
 
 
294 aa  88.6  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  37.84 
 
 
466 aa  87.8  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.17 
 
 
212 aa  87.8  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  40.83 
 
 
344 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.83 
 
 
344 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  40.83 
 
 
344 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  39.09 
 
 
218 aa  87.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  38.1 
 
 
320 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 
229 aa  87.4  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  40.83 
 
 
344 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  42.06 
 
 
219 aa  87.4  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  40.35 
 
 
167 aa  87  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  37.17 
 
 
214 aa  87  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  40 
 
 
509 aa  87  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 
262 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 
237 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 
263 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  40.83 
 
 
344 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 
1026 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  47.22 
 
 
213 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.81 
 
 
266 aa  86.3  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 
375 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.48 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  42.2 
 
 
263 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 
263 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  35.77 
 
 
229 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  33.6 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.74 
 
 
230 aa  85.5  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  39.06 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.66 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  44.04 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  40.38 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  40.38 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  45.19 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  39.47 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  39.29 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  38.64 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  40.37 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 
229 aa  84  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40.5 
 
 
350 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40.5 
 
 
350 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 
296 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 
236 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  41.28 
 
 
264 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  40.54 
 
 
607 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  41.28 
 
 
226 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  33.33 
 
 
640 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 
623 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.68 
 
 
673 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  40.74 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 
210 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39.25 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 
537 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  42.2 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  41.28 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  41.24 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5016  hypothetical protein  35 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.6 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  40.37 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  46.09 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.7 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 
466 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06186  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  34.68 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>